104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0154 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  263  8.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  57.72 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  38.58 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  28.35 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  32.03 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  28.23 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  34.86 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  27.07 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  28.68 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1955  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  30 
 
 		 127 aa  60.1  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  26.45 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  43.24 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  28.44 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  24.39 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  28.33 
 
 		 320 aa  47.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 802 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 899 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1888  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 365 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45900  nitrogen regulation protein, sigma 54-dependent response regulator NtrC (NR(I))  31.2 
 
 		 478 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  23.85 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1360  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 644 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.528402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  23.2 
 
 		 671 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 781 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 964 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45485  ethylene receptor 1  28.93 
 
 		 833 aa  45.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1215  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  29.46 
 
 		 471 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1271 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2060  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.76 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2037  response regulator receiver domain-containing protein  29.13 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119709  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 738 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  32.67 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.19 
 
 		 950 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1538  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.47 
 
 		 1218 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 1303 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 1363 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  27.13 
 
 		 1765 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  29.6 
 
 		 1023 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1555  response regulator receiver/diguanylate phosphodiesterase  34.78 
 
 		 412 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0499  response regulator receiver domain-containing protein  27.43 
 
 		 473 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.021061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  39.39 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2167  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1767 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 1767 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  42.42 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0831  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 381 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  28.67 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  37.33 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 1070 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1193 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  30 
 
 		 1214 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 		 1681 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.2 
 
 		 948 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  40.91 
 
 		 121 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2126  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 128 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438867  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0558  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 366 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000515131  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  25.78 
 
 		 676 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  27.69 
 
 		 1439 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  26.19 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2364  response regulator receiver modulated CheW protein  29.82 
 
 		 297 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1613  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 		 487 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350204  hitchhiker  0.000130728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4164  response regulator/phosphatase  26.53 
 
 		 352 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.37 
 
 		 967 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 1767 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 977 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2289  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1131 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.2 
 
 		 678 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 1158 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 383 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3633  response regulator receiver domain-containing protein  29.55 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 1771 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5358  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.65 
 
 		 235 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1202  response regulator receiver protein  30.67 
 
 		 270 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0510958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6269  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.5 
 
 		 228 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1165 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 		 1303 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  26.56 
 
 		 900 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  26.4 
 
 		 1686 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>