More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2037 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2037  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
161 aa  330  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119709  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  36.44 
 
 
440 aa  92.8  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
593 aa  90.1  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
769 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
812 aa  84.3  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
896 aa  84  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
1078 aa  84  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
530 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
669 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.45 
 
 
783 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
768 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  35.4 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
849 aa  81.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  36.54 
 
 
376 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
1032 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
765 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
980 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
550 aa  79.7  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
603 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
813 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
268 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
862 aa  79  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
619 aa  78.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  32.85 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
657 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
886 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
660 aa  77.8  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 
401 aa  77.8  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  37.61 
 
 
1113 aa  77.4  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
837 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
1439 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
781 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
753 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
400 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
656 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
1253 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
1513 aa  74.7  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
603 aa  74.3  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
1426 aa  73.9  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  33.61 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
771 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
789 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 
461 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
1039 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 
653 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1697  response regulator receiver protein  35.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.359972 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
909 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0332  response regulator receiver protein  34.65 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
544 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
1039 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  31.65 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  32.79 
 
 
511 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  33.07 
 
 
637 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
608 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  33.65 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
500 aa  70.9  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
1121 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 
873 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
1301 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
984 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1045 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 
402 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
759 aa  68.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
524 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2267  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
576 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0262742  normal  0.128517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
766 aa  67.8  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3023  response regulator receiver protein  29.82 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 
483 aa  67.4  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1023  response regulator receiver protein  32.76 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.456114  normal  0.530348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 
931 aa  67  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
1425 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
763 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 
632 aa  66.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
901 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  33.61 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2042  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
477 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.562637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
2072 aa  64.3  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  30.33 
 
 
474 aa  64.3  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5610  response regulator receiver domain-containing protein  31.5 
 
 
318 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  27.63 
 
 
1265 aa  63.9  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
644 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
921 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
758 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3825  response regulator receiver domain-containing protein  35.24 
 
 
283 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2699  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
446 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.112792  normal  0.0892885 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
1276 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2031  response regulator receiver domain-containing protein  44.29 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165379  normal  0.502331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0184  response regulator receiver protein  31.25 
 
 
302 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 
559 aa  62  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 
1325 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
991 aa  61.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
596 aa  61.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  35.58 
 
 
479 aa  60.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
347 aa  60.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 
906 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 
737 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6143  putative two-component response regulator  28.35 
 
 
300 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70790  putative two-component response regulator  29.13 
 
 
300 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.864147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>