More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3547 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  277  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  38.66 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  32.2 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  34.15 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5613  response regulator receiver  30.83 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0472806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  33.06 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  33.06 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  32.23 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4835  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.07 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643117  hitchhiker  0.00914775 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  33.33 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  33.82 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  32.38 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1636  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.394594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 740 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3585  response regulator receiver protein  40 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  32.23 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1998  response regulator receiver protein  29.93 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 679 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  32.23 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0651  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.747314  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  33.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  30 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3694  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0294659  normal  0.0188802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  30.28 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 227 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2073  hypothetical protein  30.23 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3364  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0159122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  31.93 
 
 		 137 aa  52.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  29.1 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  34.33 
 
 		 647 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  32.23 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  29.17 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0986  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491936 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3329  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1694  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  31.5 
 
 		 389 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  32.06 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  34.33 
 
 		 1960 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 679 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  30.1 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 129 aa  52  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  29.85 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0476  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0544  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  29.75 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  36 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  32.38 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  32.38 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  29.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  32.38 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4470  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370568  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  29.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1711  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.33 
 
 		 382 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  29.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  29.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  29.32 
 
 		 798 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  29.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  32.38 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  29.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  30.15 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  28.93 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  32.38 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>