More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1993 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1993  response regulator receiver protein  100 
 
 		 135 aa  277  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156439  hitchhiker  0.00339677 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  41.48 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  39.71 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  38.46 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  34.38 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0054  response regulator of ato, ornithine decarboxylase antizyme (sensor ATOS)  34.15 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00225376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  36.5 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  34.43 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1356  two component response regulator  30.71 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.189913  normal  0.21711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  36.15 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2393  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  32.26 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0136  response regulator receiver protein  32.54 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00549799  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0154  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  33.6 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6527  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498145  normal  0.0582996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22950  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.06 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1124  response regulator receiver protein  34.68 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1029  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.451045  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8462  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1578  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649884  normal  0.339688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3547  response regulator receiver protein  35.61 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4332  response regulator receiver protein  32.87 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2528  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  29.77 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  30.16 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3545  response regulator for Gln (sensor glnL) (nitrogen regulator I, NRI)  33.63 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000295304  normal  0.0892706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5359  response regulator receiver protein  35.88 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3216  two-component response regulator, CheY-like  30.4 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233496  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  35.07 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  32 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0684  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2147  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3480  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3567  response regulator receiver protein  34.96 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2989  response regulator receiver protein  35 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539609  normal  0.704166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2268  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  35.25 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  32.54 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2540  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2328  response regulator receiver protein  34.13 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1144  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  37.62 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0608  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.85 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0447  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  34.85 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2532  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  33.8 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3878  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3270  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3767  response regulator receiver protein  31.06 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 		 948 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1265  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4841  response regulator receiver protein  36.08 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  33.91 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2287  response regulator  28.8 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.26 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0372  response regulator receiver protein  37.36 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 383 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2317  response regulator receiver protein  29.01 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  32.81 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2432  response regulator, CheY-like  29.41 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  34.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3016  response regulator receiver protein  31.45 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3486  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  31.85 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3139  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 424 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  32.97 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2436  response regulator receiver protein  31.71 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.287992  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 532 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6521  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66047  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0507  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 299 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>