More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2534 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2534  response regulator receiver protein  100 
 
 		 141 aa  292  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4971  response regulator receiver and unknown domain protein  33.83 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148199  normal  0.258771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5565  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1627  response regulator receiver  35.48 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.307982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3047  two-component response regulator  27.78 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0882292  normal  0.419073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4937  response regulator receiver protein  30.3 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  33.88 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3002  response regulator receiver protein  32.84 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24335  normal  0.317219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3681  response regulator receiver  36.73 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  36.28 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5434  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.455605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2335  response regulator receiver  27.91 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.619064  normal  0.248162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0829  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00313002  normal  0.336166 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1214 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 		 355 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1161 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 370 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  31.62 
 
 		 1392 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3324  response regulator receiver protein  33.59 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0979  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.9 
 
 		 816 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 1033 aa  63.5  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0663  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527665  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5225  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1560  response regulator receiver domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.126493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1314  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 1177 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 		 1141 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2787  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00139288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5001  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1155 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1155 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1149 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1155 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6178  response regulator receiver protein  35.64 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.459958  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1524  response regulator receiver  32.23 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847446  normal  0.544157 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0119  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 230 aa  61.2  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0903  response regulator receiver protein  34.62 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.24539  decreased coverage  0.00652104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  34.82 
 
 		 233 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1269  response regulator receiver domain-containing protein  33.93 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.019586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2319  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5595  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000316112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.45 
 
 		 2301 aa  60.5  0.000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 		 2099 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  33.06 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 		 1792 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0722  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  34.23 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.84817e-16 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 778 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1120  response regulator receiver protein  33.08 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 2099 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 1356 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.78 
 
 		 1765 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 1816 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2360  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 523 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 1163 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.58 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 712 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0104  two-component response regulator  31.09 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  0.28908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1857 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 712 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0169  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1168 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 1695 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0415  response regulator receiver domain-containing protein  36.36 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3078  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 719 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3063  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0907373  normal  0.427952 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3028  two-component response regulator  29.57 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0938905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 2423 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00724  putative response regulator  28.68 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  30.77 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 811 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.43 
 
 		 344 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 		 991 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  39.45 
 
 		 2284 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4112  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4152  response regulator receiver protein  33.68 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.336467 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1767 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1767 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  30.97 
 
 		 1374 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3463  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 1333 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.245922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3486  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  30.47 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 712 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.6651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 		 1954 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 1839 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4603  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 782 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0283  response regulator receiver protein  32.33 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1847  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  34.81 
 
 		 372 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1908  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000488477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  33.04 
 
 		 356 aa  57  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0503  response regulator receiver protein  36.23 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 748 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  32.23 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>