More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0415 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0415  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
124 aa  238  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0587  response regulator receiver  58.82 
 
 
126 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1269  response regulator receiver domain-containing protein  47.37 
 
 
126 aa  108  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.019586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0643  response regulator receiver domain-containing protein  53.85 
 
 
126 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.651382  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.37 
 
 
469 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  36.89 
 
 
1016 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
944 aa  82  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
1896 aa  79.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  39.02 
 
 
1161 aa  79.7  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1155 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1155 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1857 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1839 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1155 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1149 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1356 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
120 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.26 
 
 
368 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
1964 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  39.64 
 
 
384 aa  76.6  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  40.57 
 
 
1278 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.51 
 
 
1158 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1288  response regulator receiver domain-containing protein  33.87 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3689  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4348  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
911 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  35.83 
 
 
367 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4288  CheA signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
911 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0367  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 
503 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 
1216 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
2099 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
373 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.02 
 
 
231 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
2107 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.29 
 
 
419 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  37.84 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
1158 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1136  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 
348 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1954 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  37.38 
 
 
337 aa  73.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 
531 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 
1937 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.83 
 
 
1180 aa  73.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  36.04 
 
 
1937 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
2099 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 
2539 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
462 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.67 
 
 
435 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
1695 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1278  sensory box protein/response regulator  38.33 
 
 
705 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.517683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.97 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  37.82 
 
 
1172 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0163  response regulator receiver domain-containing protein  31.67 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  36.29 
 
 
896 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.29 
 
 
896 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3542  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.19 
 
 
590 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
1161 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 
896 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0221  response regulator PleD  39.5 
 
 
460 aa  71.6  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  37.82 
 
 
1170 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  35.48 
 
 
896 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5179  response regulator receiver protein  31.75 
 
 
292 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
1195 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  33.33 
 
 
1374 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
381 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0404  response regulator receiver protein  35.83 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5033  type IV pilus response regulator PilH  35.83 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  35.48 
 
 
896 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  37.07 
 
 
764 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1917 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1767  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.64 
 
 
716 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00167565  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 
229 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  36.07 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2913  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0196751  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  34.13 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  31.45 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  35.48 
 
 
896 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1131 aa  71.2  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  38.33 
 
 
568 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  39.36 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
406 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2821  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  36.28 
 
 
305 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  39.36 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  39.36 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5307  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0137607  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  37.4 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0052  response regulator protein  39.34 
 
 
299 aa  70.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.29 
 
 
454 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
361 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  38.1 
 
 
846 aa  70.5  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1792 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1054  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.25 
 
 
359 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  34.68 
 
 
896 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>