More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0587 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0587  response regulator receiver  100 
 
 
126 aa  247  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0415  response regulator receiver domain-containing protein  58.82 
 
 
124 aa  131  3e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1269  response regulator receiver domain-containing protein  50.88 
 
 
126 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.019586  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0643  response regulator receiver domain-containing protein  52.5 
 
 
126 aa  111  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.651382  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1546  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  42.61 
 
 
368 aa  85.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  42.59 
 
 
1016 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.81 
 
 
455 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  41.59 
 
 
1131 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  45.79 
 
 
1278 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  37.5 
 
 
384 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 
916 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
902 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.35 
 
 
1896 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.32 
 
 
1917 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0435  response regulator receiver protein  38.89 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1964 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
1195 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  44.83 
 
 
1161 aa  75.9  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11533  Response regulator receiver domain protein (CheY)  36.8 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00681929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.19 
 
 
922 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
120 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  37.84 
 
 
932 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  39.82 
 
 
896 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  34.56 
 
 
932 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
920 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5171  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1857 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472035  normal  0.0675906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.82 
 
 
314 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.25 
 
 
2107 aa  73.9  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
1839 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3765  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
562 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  38.94 
 
 
896 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.09 
 
 
1816 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1924  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  40.38 
 
 
367 aa  72.8  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.620973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  38.94 
 
 
896 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  39.82 
 
 
896 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  38.94 
 
 
896 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.61 
 
 
1180 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_37014  diatom histidine kinase 2  40 
 
 
791 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.612589  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1648  histidine kinase  38.32 
 
 
1374 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.102759  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5629  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
2010 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.117507 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  39.82 
 
 
896 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
1162 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2209  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.16 
 
 
844 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  40.74 
 
 
1170 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  40.74 
 
 
1172 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1216 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
2099 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
1158 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  38.94 
 
 
896 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1153  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.89 
 
 
299 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  38.94 
 
 
896 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
2099 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5657  adenylate/guanylate cyclase  37.29 
 
 
421 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517681  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  37.93 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.62 
 
 
1356 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  34.75 
 
 
246 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 
896 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1007  chemotaxis protein CheY  36.44 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  35.71 
 
 
2301 aa  70.9  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  39.5 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
846 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  34.75 
 
 
376 aa  70.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  38.94 
 
 
896 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.96 
 
 
948 aa  70.9  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3679  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
262 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  37.17 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  40.91 
 
 
353 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1954 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
1937 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  34.45 
 
 
250 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2497  sporulation transcriptional activator Spo0A  36.07 
 
 
266 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  35.45 
 
 
1937 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1271 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  35.2 
 
 
265 aa  70.1  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0963  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.48 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.82 
 
 
677 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1420  response regulator receiver protein  32.09 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  35.48 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  34.26 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  36.04 
 
 
1695 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
1361 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
716 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  36.97 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  35.59 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1843 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  35.71 
 
 
1179 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  41.28 
 
 
513 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  40.18 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
1853 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3111  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.8 
 
 
458 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  39.56 
 
 
484 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  34.43 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  37.29 
 
 
564 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>