More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0799 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  96 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 217 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0360  response regulator receiver protein  46 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000726536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0378  response regulator receiver protein  45.5 
 
 		 204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2347  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.56815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3134  response regulator receiver protein  40.2 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2303  response regulator receiver protein  40.49 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2108  multisensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 492 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1228  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.42 
 
 		 349 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  47.29 
 
 		 457 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 383 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 383 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3544  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.75 
 
 		 322 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3111  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 328 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  48.06 
 
 		 457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01756  Response regulator CheB (receptor modification enzyme, protein-glutamate methylesterase)  42.86 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.844049  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  50 
 
 		 457 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 372 aa  116  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3072  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 353 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000480818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  47.29 
 
 		 457 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2955  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0878  response regulator receiver  43.57 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2064  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.94 
 
 		 395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18463  normal  0.544249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1864  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  47.1 
 
 		 457 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  0.121309 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1634  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 188 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2262  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.146487 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3504  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 338 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0859  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 338 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0836  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 338 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0871  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.67 
 
 		 338 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  45.04 
 
 		 457 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  44.96 
 
 		 457 aa  112  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.04 
 
 		 457 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  45.74 
 
 		 457 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3723  response regulator receiver  41.04 
 
 		 338 aa  111  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  45.74 
 
 		 455 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  41.54 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25160  response regulator  42.97 
 
 		 356 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3308  response regulator PleD  44.96 
 
 		 457 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.268667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0792  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 331 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3231  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.1 
 
 		 331 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0860  response regulator  40 
 
 		 339 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4746  response regulator PleD  46.77 
 
 		 466 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0979514  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  45.86 
 
 		 457 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3553  response regulator receiver  39.31 
 
 		 384 aa  108  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0629  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.89 
 
 		 339 aa  108  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6015  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.76 
 
 		 333 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3418  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 		 338 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  39.33 
 
 		 378 aa  108  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.51 
 
 		 457 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4336  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.23 
 
 		 310 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1054  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.33 
 
 		 359 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2248  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.28 
 
 		 331 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0716  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 		 338 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3306  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.43 
 
 		 338 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3676  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  45.11 
 
 		 457 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2505  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.07 
 
 		 331 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  45.74 
 
 		 454 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.51 
 
 		 457 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4204  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 310 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3141  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.72 
 
 		 338 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2951  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  46.51 
 
 		 457 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3109  response regulator receiver  44.17 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0893452  normal  0.677049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1044  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0516082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1988  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.51 
 
 		 435 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29300  Response regulator  38.95 
 
 		 310 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.51 
 
 		 457 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  40.71 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0962  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.115091  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0610  response regulator PleD  43.62 
 
 		 461 aa  106  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.961713  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4132  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 310 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0575  response regulator PleD  43.62 
 
 		 456 aa  106  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0912  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  34.18 
 
 		 371 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2978  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.04 
 
 		 369 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3334  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.35 
 
 		 331 aa  106  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0963  response regulator  41.98 
 
 		 441 aa  105  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3523  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.84 
 
 		 363 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0007  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.01 
 
 		 379 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.829613  normal  0.0284762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.77 
 
 		 300 aa  105  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0836  response regulator receiver protein  43.18 
 
 		 395 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0365  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.54 
 
 		 308 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50640  response regulator with metal dependent phosphohydrolase activity (two-component)  43.62 
 
 		 347 aa  105  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0748  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 312 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0218  diguanylate cyclase  42.98 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0773  response regulator PleD  41.54 
 
 		 458 aa  104  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2455  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.55 
 
 		 376 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.46136  normal  0.292815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1942  metal dependent phosphohydrolase  40.58 
 
 		 363 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1561  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.64 
 
 		 455 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4177  diguanylate cyclase  41.32 
 
 		 347 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2304  response regulator receiver protein  39.71 
 
 		 150 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0766818  normal  0.411617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1513  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.88 
 
 		 301 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  42.68 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0304  response regulator PleD  41.54 
 
 		 458 aa  102  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0864091  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  39.04 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0981  response regulator receiver protein  38.17 
 
 		 155 aa  103  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>