More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1090 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  100 
 
 		 846 aa  1734    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  37.9 
 
 		 583 aa  308  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  37.15 
 
 		 598 aa  306  1.0000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  34.82 
 
 		 556 aa  298  3e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  35.8 
 
 		 520 aa  297  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  33.22 
 
 		 595 aa  296  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  34.02 
 
 		 599 aa  294  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  37.39 
 
 		 583 aa  294  4e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.03 
 
 		 553 aa  294  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  41.71 
 
 		 417 aa  293  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.96 
 
 		 599 aa  293  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  36.02 
 
 		 520 aa  293  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  33.92 
 
 		 787 aa  293  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  41.98 
 
 		 513 aa  293  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  36.11 
 
 		 509 aa  291  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  34.51 
 
 		 520 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  34.73 
 
 		 595 aa  290  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  34.51 
 
 		 520 aa  290  8e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  35.79 
 
 		 585 aa  290  8e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  36.9 
 
 		 583 aa  289  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  34.14 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  40.5 
 
 		 484 aa  287  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.72 
 
 		 558 aa  286  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  30.81 
 
 		 746 aa  286  9e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  36.64 
 
 		 520 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  34.55 
 
 		 572 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  33.59 
 
 		 594 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  39.94 
 
 		 494 aa  284  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  31.86 
 
 		 562 aa  284  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  35.96 
 
 		 559 aa  283  1e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  38.38 
 
 		 523 aa  283  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  41.3 
 
 		 522 aa  282  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.5 
 
 		 557 aa  283  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  35.26 
 
 		 566 aa  283  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  35.89 
 
 		 514 aa  282  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  27.58 
 
 		 823 aa  282  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  33.72 
 
 		 553 aa  282  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  41 
 
 		 515 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  39.89 
 
 		 518 aa  282  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  41.3 
 
 		 495 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  41.81 
 
 		 501 aa  281  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  41 
 
 		 518 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  41 
 
 		 518 aa  281  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 577 aa  281  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  32.97 
 
 		 603 aa  281  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  40.97 
 
 		 491 aa  281  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  33.91 
 
 		 594 aa  281  5e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  34.31 
 
 		 595 aa  280  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  33.27 
 
 		 521 aa  280  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  39.17 
 
 		 511 aa  280  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 688 aa  280  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  40.99 
 
 		 521 aa  280  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  32.63 
 
 		 553 aa  280  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  37.95 
 
 		 490 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  35.12 
 
 		 523 aa  279  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 499 aa  279  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  39.55 
 
 		 489 aa  279  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  40.99 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  40.99 
 
 		 521 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 570 aa  278  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  32.09 
 
 		 571 aa  277  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  41.24 
 
 		 533 aa  277  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  34.4 
 
 		 595 aa  277  6e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  32.39 
 
 		 568 aa  277  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  41.16 
 
 		 521 aa  277  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  277  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  32.24 
 
 		 563 aa  277  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  277  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  277  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  31.74 
 
 		 871 aa  276  9e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  36.01 
 
 		 592 aa  276  9e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  40.76 
 
 		 499 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  40.7 
 
 		 521 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  40.76 
 
 		 499 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  40.76 
 
 		 499 aa  276  9e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  33.9 
 
 		 560 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  40.7 
 
 		 514 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  41.3 
 
 		 498 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  38.05 
 
 		 502 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  40.76 
 
 		 499 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 561 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  37.99 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 521 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  40.49 
 
 		 497 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  38.05 
 
 		 502 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 521 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  34.19 
 
 		 595 aa  276  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 		 521 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  31.77 
 
 		 564 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 601 aa  275  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  37.99 
 
 		 494 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  32.57 
 
 		 557 aa  275  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  33.09 
 
 		 563 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  37.12 
 
 		 514 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>