More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3033 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  59.59 
 
 		 599 aa  709    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  100 
 
 		 594 aa  1218    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  46.82 
 
 		 595 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  45.98 
 
 		 595 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  45.59 
 
 		 605 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  45.62 
 
 		 595 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 596 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  45.14 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  44.95 
 
 		 611 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  44.95 
 
 		 611 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  43.61 
 
 		 611 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  41.02 
 
 		 594 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  42.66 
 
 		 592 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  39.59 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  39.43 
 
 		 595 aa  421  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  41.85 
 
 		 601 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  40.83 
 
 		 604 aa  421  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  41.28 
 
 		 596 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  42.58 
 
 		 613 aa  413  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  41.47 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  39.37 
 
 		 611 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  42 
 
 		 597 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 595 aa  415  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  41.04 
 
 		 603 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 600 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  39.33 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  42.75 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  40.8 
 
 		 615 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  41.75 
 
 		 622 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  39.42 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  41.03 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  41.18 
 
 		 594 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  40.38 
 
 		 595 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  39.85 
 
 		 594 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  39.85 
 
 		 594 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  40.66 
 
 		 600 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.03 
 
 		 520 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.56 
 
 		 553 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.11 
 
 		 563 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  40.96 
 
 		 521 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.7 
 
 		 871 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.08 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  39.89 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 564 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.89 
 
 		 787 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 570 aa  379  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.03 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  39.58 
 
 		 570 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  40.15 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  40.15 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 558 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 557 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  40.04 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.62 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.83 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  41.32 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.37 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 571 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.43 
 
 		 557 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  38.67 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  47.66 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  47.66 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  47.83 
 
 		 500 aa  369  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  46.88 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  46.88 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.34 
 
 		 885 aa  369  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  47.66 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  47.66 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  47.66 
 
 		 499 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  47.66 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  47.14 
 
 		 497 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  47.66 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  47.66 
 
 		 497 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.81 
 
 		 564 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  46.88 
 
 		 499 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  38.17 
 
 		 554 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  46.61 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  46.61 
 
 		 499 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  46.61 
 
 		 499 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  47.48 
 
 		 482 aa  364  2e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  35.64 
 
 		 561 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  38.95 
 
 		 575 aa  361  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  46.21 
 
 		 515 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  40.74 
 
 		 489 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.39 
 
 		 573 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 487 aa  359  8e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.79 
 
 		 557 aa  359  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 567 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  37.45 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 579 aa  359  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  38.61 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  45.05 
 
 		 522 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.02 
 
 		 599 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>