More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2278 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  100 
 
 		 599 aa  1212    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  59.59 
 
 		 594 aa  709    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  46.67 
 
 		 595 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  48.11 
 
 		 595 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  46.58 
 
 		 605 aa  505  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  48.28 
 
 		 596 aa  490  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  43.82 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  46.77 
 
 		 611 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  45.9 
 
 		 611 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  43.93 
 
 		 592 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  42.08 
 
 		 595 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  42.65 
 
 		 604 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  42.66 
 
 		 597 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 600 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  42.44 
 
 		 594 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  41.44 
 
 		 595 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  42.22 
 
 		 613 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  42.91 
 
 		 613 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  41.04 
 
 		 595 aa  410  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 603 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  42.88 
 
 		 594 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  42.29 
 
 		 600 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  41.65 
 
 		 598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  41.97 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  43.48 
 
 		 594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 611 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  41.65 
 
 		 595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  41.65 
 
 		 598 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  42.86 
 
 		 594 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  42.6 
 
 		 601 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  41.59 
 
 		 594 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  42.86 
 
 		 594 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  42.28 
 
 		 594 aa  395  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 622 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 615 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.31 
 
 		 562 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.84 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.27 
 
 		 553 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.62 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  38.48 
 
 		 563 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 561 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.03 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 564 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.02 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.14 
 
 		 558 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.1 
 
 		 520 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  41.07 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.19 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.62 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.62 
 
 		 787 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.18 
 
 		 555 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  41.2 
 
 		 561 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  41.77 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  36.66 
 
 		 553 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40.24 
 
 		 559 aa  362  1e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.92 
 
 		 564 aa  360  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.36 
 
 		 571 aa  360  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 576 aa  358  9.999999999999999e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  42.24 
 
 		 585 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  42.6 
 
 		 585 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.71 
 
 		 557 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  37.95 
 
 		 567 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.31 
 
 		 553 aa  357  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  48.56 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  36.72 
 
 		 570 aa  355  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.09 
 
 		 571 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.61 
 
 		 871 aa  355  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.69 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  38.11 
 
 		 577 aa  353  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  39.52 
 
 		 520 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  37.86 
 
 		 583 aa  353  7e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  39.52 
 
 		 520 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 885 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  48.04 
 
 		 497 aa  352  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.49 
 
 		 568 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  36.83 
 
 		 585 aa  351  2e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.12 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.04 
 
 		 568 aa  351  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  48.04 
 
 		 499 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  48.04 
 
 		 499 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 563 aa  350  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  46.53 
 
 		 500 aa  350  5e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  38.12 
 
 		 574 aa  350  5e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.33 
 
 		 563 aa  350  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  47.78 
 
 		 497 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 561 aa  350  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.67 
 
 		 571 aa  350  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  47.78 
 
 		 497 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  48.04 
 
 		 499 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  47.78 
 
 		 497 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  47.78 
 
 		 497 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  47.78 
 
 		 497 aa  350  5e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  48.04 
 
 		 499 aa  350  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>