More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  56.4 
 
 		 600 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  80.64 
 
 		 594 aa  994    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  56.72 
 
 		 598 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  80.64 
 
 		 594 aa  992    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  58.89 
 
 		 613 aa  680    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  59.31 
 
 		 604 aa  665    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  56.88 
 
 		 595 aa  677    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  56.97 
 
 		 611 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  62.44 
 
 		 622 aa  695    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  56.38 
 
 		 597 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  82.68 
 
 		 594 aa  994    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  98.82 
 
 		 594 aa  1209    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  68.54 
 
 		 601 aa  814    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  79.12 
 
 		 594 aa  966    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  57.27 
 
 		 595 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  60.91 
 
 		 592 aa  748    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  58.13 
 
 		 594 aa  697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  55.71 
 
 		 603 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  56.71 
 
 		 595 aa  670    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  56.72 
 
 		 598 aa  655    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  85.69 
 
 		 594 aa  1044    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  57.49 
 
 		 595 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  55.77 
 
 		 600 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  100 
 
 		 594 aa  1219    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  59.26 
 
 		 596 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  57.65 
 
 		 613 aa  632  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  57.04 
 
 		 615 aa  627  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  56.6 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  56.25 
 
 		 557 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  55.44 
 
 		 561 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  55.21 
 
 		 557 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  48.05 
 
 		 595 aa  520  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  48.26 
 
 		 596 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  47.04 
 
 		 595 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  48.24 
 
 		 595 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  46.55 
 
 		 605 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  43.15 
 
 		 611 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  41.85 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  42.02 
 
 		 611 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  41.85 
 
 		 611 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 594 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 599 aa  422  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.79 
 
 		 599 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.05 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.52 
 
 		 603 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.79 
 
 		 599 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.41 
 
 		 787 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.36 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.17 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  41.62 
 
 		 599 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  38.62 
 
 		 585 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.77 
 
 		 557 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.8 
 
 		 575 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.32 
 
 		 571 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.9 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.43 
 
 		 568 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 568 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.41 
 
 		 871 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.05 
 
 		 570 aa  368  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.1 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.01 
 
 		 558 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  41.82 
 
 		 518 aa  364  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  40.89 
 
 		 489 aa  363  4e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  36.82 
 
 		 565 aa  363  4e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.5 
 
 		 568 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.68 
 
 		 568 aa  363  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.5 
 
 		 568 aa  363  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 561 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.83 
 
 		 565 aa  362  8e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.12 
 
 		 569 aa  362  9e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  47.12 
 
 		 569 aa  362  9e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.75 
 
 		 563 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  42.03 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 564 aa  360  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  41.43 
 
 		 502 aa  361  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  40.64 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  40.88 
 
 		 520 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.01 
 
 		 556 aa  360  5e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.36 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 891 aa  359  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  41.12 
 
 		 550 aa  359  8e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.22 
 
 		 570 aa  359  9e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.62 
 
 		 574 aa  359  9e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  41.27 
 
 		 521 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.5 
 
 		 580 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  45.07 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  38.45 
 
 		 560 aa  357  5e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.76 
 
 		 568 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.93 
 
 		 571 aa  356  5.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  43.96 
 
 		 571 aa  356  7.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  41.91 
 
 		 523 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.91 
 
 		 577 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.91 
 
 		 577 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  45.76 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.7 
 
 		 572 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  46.68 
 
 		 571 aa  355  2e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.57 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  47.33 
 
 		 566 aa  355  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>