More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5097 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  98.03 
 
 		 557 aa  1090    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  76.65 
 
 		 561 aa  834    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  100 
 
 		 557 aa  1115    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  90.66 
 
 		 557 aa  984    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  58.23 
 
 		 594 aa  629  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  58.61 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  56.42 
 
 		 594 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  56.35 
 
 		 594 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  54.98 
 
 		 594 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  56.6 
 
 		 594 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  57.45 
 
 		 594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  51.54 
 
 		 601 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  51.05 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  50 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  49.66 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  50.52 
 
 		 600 aa  545  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  47.45 
 
 		 595 aa  542  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  48.6 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  50.74 
 
 		 598 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  49.05 
 
 		 592 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  50.74 
 
 		 598 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  51.11 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  52.75 
 
 		 615 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  48.43 
 
 		 603 aa  535  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  47.28 
 
 		 595 aa  535  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  50.34 
 
 		 604 aa  538  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  49.48 
 
 		 613 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  52.4 
 
 		 611 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  51.03 
 
 		 622 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  51.65 
 
 		 595 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  49.17 
 
 		 594 aa  520  1e-146  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  45.15 
 
 		 595 aa  464  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  45.9 
 
 		 596 aa  464  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  46.28 
 
 		 595 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  46.65 
 
 		 595 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  43.95 
 
 		 605 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 611 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  42.17 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 599 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  40.49 
 
 		 594 aa  386  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.73 
 
 		 555 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.73 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  40.77 
 
 		 580 aa  348  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.56 
 
 		 599 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.08 
 
 		 571 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.56 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.02 
 
 		 603 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.79 
 
 		 568 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.56 
 
 		 599 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  44.67 
 
 		 471 aa  343  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.2 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.28 
 
 		 568 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.11 
 
 		 585 aa  340  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.57 
 
 		 568 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.43 
 
 		 570 aa  340  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.76 
 
 		 568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.57 
 
 		 568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 564 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  39.65 
 
 		 563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.5 
 
 		 568 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  39.55 
 
 		 553 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  36.95 
 
 		 568 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  41.31 
 
 		 550 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  39.68 
 
 		 521 aa  335  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.61 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  37.04 
 
 		 577 aa  334  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  39.69 
 
 		 575 aa  334  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  42.98 
 
 		 477 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  39.18 
 
 		 520 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  48.17 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.76 
 
 		 563 aa  332  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  47.55 
 
 		 462 aa  332  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  47.55 
 
 		 462 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  44.85 
 
 		 561 aa  332  9e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.11 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  35.82 
 
 		 558 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.34 
 
 		 571 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  35.43 
 
 		 566 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  44.16 
 
 		 474 aa  331  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  44.13 
 
 		 463 aa  330  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  39.31 
 
 		 586 aa  331  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  37.84 
 
 		 561 aa  330  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  37.75 
 
 		 571 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  42.49 
 
 		 871 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.72 
 
 		 571 aa  329  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.34 
 
 		 563 aa  329  7e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  34.56 
 
 		 583 aa  329  9e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  39.74 
 
 		 891 aa  329  9e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  36.56 
 
 		 585 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 568 aa  329  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  42.47 
 
 		 474 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.07 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.07 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  44.5 
 
 		 585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  40.4 
 
 		 518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  40.41 
 
 		 515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.52 
 
 		 570 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>