More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5250 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  91.2 
 
 		 557 aa  992    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  78.07 
 
 		 561 aa  847    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  90.66 
 
 		 557 aa  984    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  100 
 
 		 557 aa  1119    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  57.61 
 
 		 594 aa  622  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  56.87 
 
 		 594 aa  617  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  55.03 
 
 		 594 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  55.03 
 
 		 594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  54.86 
 
 		 594 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  55.38 
 
 		 594 aa  598  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  57.22 
 
 		 594 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  50.87 
 
 		 613 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  50 
 
 		 595 aa  551  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  52.21 
 
 		 601 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  49.4 
 
 		 600 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  51.58 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  52.66 
 
 		 615 aa  542  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  48.95 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  50.51 
 
 		 604 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  48.7 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  49.4 
 
 		 592 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  48.7 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  50.93 
 
 		 603 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  46.6 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  52.58 
 
 		 611 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  50.18 
 
 		 596 aa  535  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  49.82 
 
 		 613 aa  527  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  51.77 
 
 		 595 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  46.43 
 
 		 595 aa  523  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  50.35 
 
 		 622 aa  518  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  46.83 
 
 		 594 aa  512  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  45.9 
 
 		 595 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 595 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  45.29 
 
 		 596 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  45.9 
 
 		 595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  43.76 
 
 		 605 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  42.36 
 
 		 611 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  41.8 
 
 		 611 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  41.8 
 
 		 611 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  41.8 
 
 		 611 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  39.65 
 
 		 594 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 599 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.16 
 
 		 555 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.81 
 
 		 580 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 553 aa  350  3e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.79 
 
 		 568 aa  349  9e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.14 
 
 		 568 aa  347  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.48 
 
 		 568 aa  346  7e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 553 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.99 
 
 		 553 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.95 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.14 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.31 
 
 		 599 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  36.95 
 
 		 568 aa  340  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  39.73 
 
 		 520 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.16 
 
 		 570 aa  339  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.12 
 
 		 599 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  43.76 
 
 		 471 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.08 
 
 		 603 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.12 
 
 		 599 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  39.58 
 
 		 563 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.75 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  36.78 
 
 		 571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 564 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40.73 
 
 		 586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  36.38 
 
 		 577 aa  336  7e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 561 aa  336  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  36.42 
 
 		 558 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.38 
 
 		 563 aa  334  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  37.98 
 
 		 585 aa  334  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.74 
 
 		 568 aa  333  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  42.77 
 
 		 477 aa  333  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.78 
 
 		 571 aa  333  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 561 aa  332  8e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  44.39 
 
 		 474 aa  332  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  39.53 
 
 		 521 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  34.67 
 
 		 566 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  44.33 
 
 		 561 aa  330  3e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  38.72 
 
 		 575 aa  331  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  42.09 
 
 		 515 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  47.64 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 571 aa  330  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0645  general secretory pathway protein E  47.06 
 
 		 462 aa  330  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0666  general secretory pathway protein E  47.06 
 
 		 462 aa  330  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.726571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  40.4 
 
 		 518 aa  330  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  35.23 
 
 		 583 aa  329  8e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  44.01 
 
 		 585 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  38.37 
 
 		 520 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  44.44 
 
 		 585 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  41.44 
 
 		 499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.67 
 
 		 571 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  44.07 
 
 		 474 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  36.4 
 
 		 557 aa  326  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.29 
 
 		 562 aa  326  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 520 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 550 aa  326  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  38.25 
 
 		 520 aa  326  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.75 
 
 		 570 aa  326  7e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.76 
 
 		 514 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>