More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0364 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  55.36 
 
 		 611 aa  639    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  59.39 
 
 		 594 aa  716    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  59.39 
 
 		 594 aa  711    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  53.31 
 
 		 595 aa  650    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  58.38 
 
 		 622 aa  665    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  59.83 
 
 		 594 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  60.91 
 
 		 594 aa  729    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  100 
 
 		 592 aa  1223    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  55.42 
 
 		 594 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  61.03 
 
 		 601 aa  747    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  53.52 
 
 		 595 aa  643    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  53.82 
 
 		 595 aa  660    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  59.79 
 
 		 594 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  60.17 
 
 		 594 aa  718    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  61.43 
 
 		 594 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  57.32 
 
 		 596 aa  678    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  55.3 
 
 		 604 aa  642    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  52.66 
 
 		 613 aa  630  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  52.84 
 
 		 603 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  52.96 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  52.05 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  52.96 
 
 		 598 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  52.9 
 
 		 597 aa  620  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  53.36 
 
 		 595 aa  621  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  53.92 
 
 		 613 aa  621  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  52.59 
 
 		 600 aa  618  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  54.25 
 
 		 615 aa  602  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  48.44 
 
 		 557 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  48.27 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 557 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  47.91 
 
 		 595 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  48.66 
 
 		 595 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  48.02 
 
 		 561 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  48.47 
 
 		 595 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  47.41 
 
 		 605 aa  487  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  48.64 
 
 		 596 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  44.2 
 
 		 611 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 611 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 611 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 611 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  42.66 
 
 		 594 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  43.93 
 
 		 599 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.66 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.93 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  47.64 
 
 		 787 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.55 
 
 		 580 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.44 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  41.13 
 
 		 599 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.65 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 564 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.46 
 
 		 570 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.44 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.52 
 
 		 599 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.84 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.59 
 
 		 599 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  49.35 
 
 		 553 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  38.98 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.08 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.37 
 
 		 603 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.5 
 
 		 571 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.66 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  40.08 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47.15 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.31 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.94 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.81 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.45 
 
 		 558 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  37.55 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.41 
 
 		 557 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  43.34 
 
 		 585 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.34 
 
 		 563 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  43.34 
 
 		 585 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.55 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.16 
 
 		 557 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.74 
 
 		 568 aa  363  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.2 
 
 		 561 aa  363  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 563 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.85 
 
 		 871 aa  362  8e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40.4 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.68 
 
 		 559 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  37.33 
 
 		 558 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38 
 
 		 568 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  46.92 
 
 		 577 aa  360  4e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  46.65 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  38.81 
 
 		 513 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  47.53 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  47.53 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  47.79 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  47.79 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  47.79 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  47.79 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  47.79 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  47.79 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  47.79 
 
 		 497 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  41.48 
 
 		 497 aa  359  9e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  47.27 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.71 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.01 
 
 		 562 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  45.71 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>