More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3984 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  59.09 
 
 		 613 aa  650    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  56.2 
 
 		 613 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  57.34 
 
 		 594 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  55.33 
 
 		 600 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  54.93 
 
 		 598 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  100 
 
 		 611 aa  1237    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  56.21 
 
 		 595 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  55.3 
 
 		 592 aa  647    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  54.62 
 
 		 594 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  55.21 
 
 		 601 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  55.16 
 
 		 595 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  81.77 
 
 		 604 aa  968    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  55.57 
 
 		 596 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  54.93 
 
 		 598 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  57.47 
 
 		 594 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  55.25 
 
 		 594 aa  633  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  56.48 
 
 		 594 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  54.36 
 
 		 594 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  54.53 
 
 		 594 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  53.76 
 
 		 597 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  58.78 
 
 		 594 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  57.65 
 
 		 615 aa  626  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  53.68 
 
 		 603 aa  624  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  53.31 
 
 		 600 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  54.92 
 
 		 622 aa  615  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  51.64 
 
 		 595 aa  598  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  52.65 
 
 		 595 aa  594  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  51.39 
 
 		 561 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  51.2 
 
 		 557 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  51.39 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  51.39 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  46.97 
 
 		 595 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  47.93 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  47.37 
 
 		 596 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  47.23 
 
 		 605 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  44.77 
 
 		 611 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  43.93 
 
 		 611 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  43.57 
 
 		 611 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  43.93 
 
 		 611 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  39.37 
 
 		 594 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 599 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.59 
 
 		 570 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.51 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  42.3 
 
 		 563 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.99 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  43.56 
 
 		 603 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.4 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.75 
 
 		 559 aa  377  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.91 
 
 		 599 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.55 
 
 		 568 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.1 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  48.22 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.22 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 891 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  42.94 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.97 
 
 		 553 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.04 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  48.45 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.25 
 
 		 557 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  42.41 
 
 		 521 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.85 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.45 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.08 
 
 		 558 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  48.69 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.85 
 
 		 565 aa  372  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.72 
 
 		 599 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  48.45 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  48.57 
 
 		 497 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  48.45 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  47.49 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  48.33 
 
 		 498 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.11 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  41.45 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.44 
 
 		 580 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  38.92 
 
 		 569 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  47.26 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.75 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.26 
 
 		 520 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.84 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  47.97 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  41.65 
 
 		 520 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.77 
 
 		 571 aa  369  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.92 
 
 		 569 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  50.26 
 
 		 575 aa  365  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.32 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  47.73 
 
 		 499 aa  364  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.24 
 
 		 580 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.3 
 
 		 561 aa  363  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.59 
 
 		 787 aa  362  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.77 
 
 		 563 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>