More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0766 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  57.19 
 
 		 604 aa  662    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  55.31 
 
 		 595 aa  641    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  57.19 
 
 		 594 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  57.54 
 
 		 594 aa  662    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  60.68 
 
 		 622 aa  699    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  58.55 
 
 		 594 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  59.76 
 
 		 594 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  100 
 
 		 596 aa  1224    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  57.37 
 
 		 592 aa  686    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  58.39 
 
 		 594 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  56.78 
 
 		 603 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  59.45 
 
 		 594 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  59.79 
 
 		 594 aa  680    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  57.44 
 
 		 613 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  55.04 
 
 		 611 aa  640    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  58.7 
 
 		 601 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  56.58 
 
 		 600 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  59.26 
 
 		 594 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  55.54 
 
 		 613 aa  634  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  53.66 
 
 		 595 aa  633  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  55.04 
 
 		 597 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  53.9 
 
 		 600 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  54.75 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  54.75 
 
 		 598 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  52.73 
 
 		 595 aa  624  1e-177  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  55 
 
 		 595 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  56.76 
 
 		 615 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  48.35 
 
 		 557 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  48.35 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  47.66 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  47.95 
 
 		 561 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  46.59 
 
 		 595 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  45.63 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 605 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  45.63 
 
 		 595 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  46.14 
 
 		 596 aa  482  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  43.48 
 
 		 611 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  43.48 
 
 		 611 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  43.59 
 
 		 611 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 611 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  40.2 
 
 		 594 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  40.14 
 
 		 599 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 556 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  40.32 
 
 		 555 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.81 
 
 		 603 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.04 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40.04 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.81 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.19 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 787 aa  368  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.37 
 
 		 891 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.72 
 
 		 571 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 		 521 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.71 
 
 		 571 aa  363  5.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  37.5 
 
 		 585 aa  363  5.0000000000000005e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38 
 
 		 570 aa  362  8e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.73 
 
 		 568 aa  362  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.04 
 
 		 564 aa  362  2e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 563 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  38 
 
 		 598 aa  360  3e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 553 aa  361  3e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.01 
 
 		 557 aa  358  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  37.24 
 
 		 585 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.08 
 
 		 558 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.49 
 
 		 561 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.25 
 
 		 568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 583 aa  356  5.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 558 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.25 
 
 		 570 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  38.79 
 
 		 561 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.14 
 
 		 557 aa  354  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  39.77 
 
 		 520 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40.33 
 
 		 559 aa  353  7e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.03 
 
 		 568 aa  352  8e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  42.11 
 
 		 500 aa  352  8.999999999999999e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.71 
 
 		 553 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  43.36 
 
 		 570 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.04 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.16 
 
 		 563 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  36.92 
 
 		 568 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  38.31 
 
 		 561 aa  351  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  38.85 
 
 		 577 aa  351  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  42.01 
 
 		 557 aa  350  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  46.37 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.11 
 
 		 565 aa  350  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.07 
 
 		 568 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.85 
 
 		 568 aa  349  8e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 546 aa  349  8e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  38.36 
 
 		 871 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  45.99 
 
 		 579 aa  349  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.28 
 
 		 573 aa  349  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.73 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.73 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.24 
 
 		 568 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  39.38 
 
 		 520 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 561 aa  346  5e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  34.01 
 
 		 583 aa  346  7e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.76 
 
 		 553 aa  346  8e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>