More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2310 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  61.73 
 
 		 595 aa  744    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  63.54 
 
 		 598 aa  756    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  100 
 
 		 615 aa  1241    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  62.33 
 
 		 597 aa  747    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  58.56 
 
 		 622 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  63.54 
 
 		 613 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  62.54 
 
 		 595 aa  736    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  61.8 
 
 		 603 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  62.84 
 
 		 600 aa  751    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  63.54 
 
 		 598 aa  756    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  63.01 
 
 		 600 aa  730    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  66.72 
 
 		 613 aa  800    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  58.05 
 
 		 611 aa  627  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  53.74 
 
 		 594 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  56.08 
 
 		 596 aa  618  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  55.56 
 
 		 604 aa  612  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  54.74 
 
 		 601 aa  610  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  53.31 
 
 		 592 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  56.49 
 
 		 594 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  56.49 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  55.57 
 
 		 594 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  55.02 
 
 		 594 aa  598  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  54.39 
 
 		 594 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  53.04 
 
 		 595 aa  595  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  54.39 
 
 		 594 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  53.68 
 
 		 594 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  52.47 
 
 		 595 aa  588  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  51.84 
 
 		 557 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  49.57 
 
 		 557 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 561 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  47.27 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  44.46 
 
 		 595 aa  477  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  44.3 
 
 		 595 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  43.99 
 
 		 605 aa  462  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  46.79 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  44.72 
 
 		 611 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  44.9 
 
 		 611 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  44.9 
 
 		 611 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  40.8 
 
 		 594 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.53 
 
 		 563 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 555 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.09 
 
 		 570 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 577 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.98 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.44 
 
 		 599 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.23 
 
 		 599 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.23 
 
 		 599 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  49.13 
 
 		 575 aa  360  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.42 
 
 		 568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.07 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.31 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.97 
 
 		 603 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  39.62 
 
 		 521 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  36.88 
 
 		 598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.09 
 
 		 568 aa  357  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.15 
 
 		 553 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  35.47 
 
 		 561 aa  356  8.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  39.33 
 
 		 563 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.47 
 
 		 571 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.95 
 
 		 553 aa  353  5e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  50.37 
 
 		 578 aa  353  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.23 
 
 		 585 aa  353  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 885 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  39.54 
 
 		 520 aa  352  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.21 
 
 		 562 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  35.43 
 
 		 787 aa  351  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.09 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  42.37 
 
 		 585 aa  351  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.13 
 
 		 557 aa  351  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  35.36 
 
 		 564 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  42.22 
 
 		 585 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 558 aa  350  6e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 568 aa  349  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.43 
 
 		 568 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 553 aa  349  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  36.43 
 
 		 871 aa  347  5e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.28 
 
 		 559 aa  346  7e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.36 
 
 		 563 aa  346  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 563 aa  346  8.999999999999999e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  42.3 
 
 		 518 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  46.73 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.5 
 
 		 561 aa  345  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  42.45 
 
 		 518 aa  345  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.68 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.42 
 
 		 568 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.42 
 
 		 568 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 557 aa  343  4e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  35.36 
 
 		 583 aa  343  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  43.18 
 
 		 513 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  39.38 
 
 		 571 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.13 
 
 		 568 aa  343  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  44.33 
 
 		 888 aa  343  8e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.13 
 
 		 568 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  34.54 
 
 		 566 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  46.44 
 
 		 578 aa  341  2e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.32 
 
 		 580 aa  342  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  39.03 
 
 		 520 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>