More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0889 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  54.97 
 
 		 601 aa  673    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  55.1 
 
 		 594 aa  646    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  54.59 
 
 		 594 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  100 
 
 		 595 aa  1233    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  55.37 
 
 		 594 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  53.31 
 
 		 592 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  56.14 
 
 		 594 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  95.8 
 
 		 595 aa  1188    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  56.54 
 
 		 594 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  56.51 
 
 		 594 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  57.05 
 
 		 594 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  57.09 
 
 		 594 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  55.27 
 
 		 596 aa  628  1e-178  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  54.64 
 
 		 622 aa  622  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  52.13 
 
 		 598 aa  615  1e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  52.13 
 
 		 598 aa  615  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  51.36 
 
 		 613 aa  617  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  50.92 
 
 		 595 aa  610  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  51.27 
 
 		 600 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  51.53 
 
 		 603 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  53.06 
 
 		 600 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  51.36 
 
 		 597 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  52.58 
 
 		 613 aa  598  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  51.55 
 
 		 611 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  53.06 
 
 		 595 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  53.04 
 
 		 615 aa  594  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  52.35 
 
 		 604 aa  593  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  47.01 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  46.85 
 
 		 557 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  46.17 
 
 		 557 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  45.38 
 
 		 561 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  44.02 
 
 		 595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  42.09 
 
 		 595 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 605 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  43.64 
 
 		 595 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  44.53 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  44.53 
 
 		 611 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  44.15 
 
 		 611 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  42.68 
 
 		 611 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  42.18 
 
 		 596 aa  432  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  41.04 
 
 		 599 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40.71 
 
 		 599 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.71 
 
 		 599 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.71 
 
 		 599 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.76 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.41 
 
 		 603 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  39.37 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  41.38 
 
 		 573 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.24 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  37.62 
 
 		 787 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.31 
 
 		 568 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.52 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.66 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.75 
 
 		 568 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.55 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.34 
 
 		 566 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.96 
 
 		 568 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.56 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 		 520 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 		 520 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.79 
 
 		 564 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 571 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.97 
 
 		 563 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.57 
 
 		 871 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.9 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  46.79 
 
 		 553 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.91 
 
 		 553 aa  369  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.78 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.05 
 
 		 553 aa  365  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  46.04 
 
 		 575 aa  365  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.59 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.69 
 
 		 571 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 556 aa  363  4e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.27 
 
 		 557 aa  363  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  38 
 
 		 585 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  39.19 
 
 		 571 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  37.62 
 
 		 577 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.4 
 
 		 568 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.87 
 
 		 562 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.21 
 
 		 568 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.71 
 
 		 549 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.19 
 
 		 571 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.59 
 
 		 569 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  38.59 
 
 		 569 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  46.15 
 
 		 520 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  35.75 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.68 
 
 		 563 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.45 
 
 		 555 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  35.85 
 
 		 561 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  38.02 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 		 524 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 558 aa  355  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  45.89 
 
 		 474 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 513 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.6 
 
 		 570 aa  353  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  45.01 
 
 		 580 aa  353  4e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  45.64 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  42.82 
 
 		 520 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>