More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3239 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  75.63 
 
 		 598 aa  954    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  79.2 
 
 		 613 aa  976    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  100 
 
 		 600 aa  1235    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  75.63 
 
 		 598 aa  954    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  56.86 
 
 		 622 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  76.26 
 
 		 597 aa  962    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  80.17 
 
 		 595 aa  969    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  53.12 
 
 		 594 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  86.24 
 
 		 603 aa  1088    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  75.21 
 
 		 600 aa  945    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  54.3 
 
 		 601 aa  648    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  62.84 
 
 		 615 aa  742    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  67.18 
 
 		 613 aa  821    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  77.3 
 
 		 595 aa  983    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  57.24 
 
 		 596 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  55.94 
 
 		 594 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  56.34 
 
 		 594 aa  628  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  55.36 
 
 		 594 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  55.54 
 
 		 594 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  55.96 
 
 		 594 aa  626  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  55.46 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  55.54 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  52.48 
 
 		 611 aa  618  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  52.05 
 
 		 592 aa  619  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  52.86 
 
 		 604 aa  608  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  53.06 
 
 		 595 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  52.89 
 
 		 595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  49.13 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  48.6 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  48.95 
 
 		 557 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  48.08 
 
 		 561 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  47.26 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  45.95 
 
 		 595 aa  479  1e-134  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  46.48 
 
 		 605 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 596 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  44.91 
 
 		 611 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  44.91 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  42.22 
 
 		 611 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  44.91 
 
 		 611 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 599 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 594 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.57 
 
 		 555 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 570 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.8 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.77 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.41 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 787 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.77 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.77 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.24 
 
 		 574 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.54 
 
 		 599 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.89 
 
 		 563 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  37.81 
 
 		 571 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.84 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40.84 
 
 		 599 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.05 
 
 		 891 aa  368  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  46.77 
 
 		 603 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 553 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 563 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  36.72 
 
 		 561 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.49 
 
 		 571 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.21 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 885 aa  361  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.21 
 
 		 557 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.02 
 
 		 553 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.1 
 
 		 580 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  40.16 
 
 		 586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  36.22 
 
 		 585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.3 
 
 		 577 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.98 
 
 		 568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.08 
 
 		 568 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  41 
 
 		 521 aa  357  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.61 
 
 		 571 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.5 
 
 		 555 aa  356  5.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  42.83 
 
 		 515 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  45.89 
 
 		 487 aa  356  7.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  37.36 
 
 		 564 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 558 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.53 
 
 		 575 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.8 
 
 		 571 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.59 
 
 		 558 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.07 
 
 		 573 aa  353  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.35 
 
 		 575 aa  353  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.47 
 
 		 559 aa  353  5e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  37.72 
 
 		 560 aa  353  5.9999999999999994e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.76 
 
 		 578 aa  353  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.19 
 
 		 578 aa  352  8e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.3 
 
 		 888 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2960  type II secretion system protein E  38.93 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.29 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.56 
 
 		 568 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.05 
 
 		 871 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  39.2 
 
 		 573 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  40.52 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  37.45 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  38.89 
 
 		 577 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>