More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2672 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  100 
 
 
611 aa  1219    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  98.85 
 
 
611 aa  1208    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  88.69 
 
 
611 aa  1108    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  100 
 
 
611 aa  1219    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  47.93 
 
 
595 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  49.16 
 
 
595 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  49.92 
 
 
596 aa  567  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  47.6 
 
 
595 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  44.46 
 
 
605 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  42.18 
 
 
601 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  43.45 
 
 
592 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  46.48 
 
 
599 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  42.96 
 
 
594 aa  465  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  44.95 
 
 
594 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  46.17 
 
 
613 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  45.18 
 
 
597 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  43.48 
 
 
596 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  45.85 
 
 
595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
595 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  44.9 
 
 
615 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  44.91 
 
 
600 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  45.09 
 
 
600 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  46.07 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  46.07 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  42.76 
 
 
594 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  45.47 
 
 
603 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  42.78 
 
 
595 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  42.4 
 
 
604 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  43.93 
 
 
611 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  41.8 
 
 
594 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  45.42 
 
 
613 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  44.64 
 
 
594 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  40.3 
 
 
594 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  41.91 
 
 
594 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  44.53 
 
 
595 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  43.48 
 
 
622 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  42.2 
 
 
594 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  42.53 
 
 
594 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  38.11 
 
 
871 aa  395  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  41.22 
 
 
557 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.08 
 
 
573 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.99 
 
 
520 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.16 
 
 
564 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.75 
 
 
558 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  41.04 
 
 
557 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.3 
 
 
568 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  35.4 
 
 
787 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.7 
 
 
568 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
557 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
561 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.23 
 
 
553 aa  385  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.78 
 
 
570 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.1 
 
 
520 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  40.23 
 
 
568 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
558 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.66 
 
 
568 aa  376  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.41 
 
 
568 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.5 
 
 
571 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
568 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.19 
 
 
570 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.29 
 
 
520 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  40.44 
 
 
823 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
561 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.26 
 
 
568 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.04 
 
 
553 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.29 
 
 
520 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.26 
 
 
568 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.17 
 
 
568 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.71 
 
 
566 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  39.39 
 
 
806 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.08 
 
 
563 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.17 
 
 
568 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.93 
 
 
555 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.22 
 
 
571 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.43 
 
 
561 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  36.89 
 
 
562 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.91 
 
 
514 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  39.62 
 
 
577 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 
599 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.56 
 
 
557 aa  364  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.9 
 
 
553 aa  364  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.85 
 
 
568 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.87 
 
 
599 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  36.87 
 
 
577 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.79 
 
 
563 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.42 
 
 
571 aa  359  6e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.13 
 
 
554 aa  359  7e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  37.39 
 
 
563 aa  359  8e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.16 
 
 
557 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.32 
 
 
571 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.69 
 
 
561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.36 
 
 
553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.49 
 
 
599 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  40.31 
 
 
569 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.31 
 
 
569 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  40.15 
 
 
564 aa  356  6.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.77 
 
 
585 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  39.77 
 
 
521 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.55 
 
 
603 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.3 
 
 
565 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>