More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2126 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2126  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  255  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2827  response regulator receiver domain-containing protein  53.23 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107479 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0953  response regulator receiver domain-containing protein  56.3 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.83954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3223  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.186882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1038  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0886  response regulator receiver domain-containing protein  39.52 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384988  normal  0.153587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0159  response regulator receiver domain-containing protein  47.11 
 
 		 128 aa  107  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0749254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0893  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.605635  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1017  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3089  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.22915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.83 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3767  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.401563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1037 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  38.14 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3042  two-component response regulator  33.06 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.330896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 		 1141 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 237 aa  72  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  38.46 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.17 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  38.46 
 
 		 225 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.17 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  37.29 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.07 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  37.29 
 
 		 229 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 1177 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2076  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 2107 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 1195 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0687  DNA-binding response regulator  37.07 
 
 		 225 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01602  type IV pilus response regulator PilG  34.45 
 
 		 117 aa  71.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0213  DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0254  DNA-binding response regulator  37.29 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000466037 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  34.71 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5308  response regulator receiver domain-containing protein  32.33 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0630269  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 425 aa  71.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 1143 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 1896 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1816 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 163 aa  70.5  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 945 aa  70.5  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 2539 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3996  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 1159 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4359  two component transcriptional regulator  34.45 
 
 		 229 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.82 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4292  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  34.82 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  38.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  38.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.92 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0131  response regulator receiver  31.09 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  38.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2904  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.66 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.66 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  35.25 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 238 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  38.66 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.5 
 
 		 443 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  32.77 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2400  response regulator receiver protein  32 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.726464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.9 
 
 		 1159 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 1145 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.25 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5034  type IV pilus response regulator PilG  30.4 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0403  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0488  response regulator receiver  30.4 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  35.25 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  35.25 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>