More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0884 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  100 
 
 		 425 aa  853    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  49.26 
 
 		 282 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  46.4 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  47.62 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  44.68 
 
 		 301 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  46.86 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  47.19 
 
 		 269 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  49.08 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  46.74 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  47.64 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  44.18 
 
 		 301 aa  199  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  40.96 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  37.74 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  45.09 
 
 		 265 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  41.51 
 
 		 287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  41.73 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  40.36 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  46.06 
 
 		 274 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  40.21 
 
 		 285 aa  177  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  38.3 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  42.81 
 
 		 274 aa  177  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  39.02 
 
 		 483 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  37.58 
 
 		 303 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  39.71 
 
 		 286 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  39.15 
 
 		 289 aa  173  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  41.13 
 
 		 275 aa  172  9e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  38.18 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  38.75 
 
 		 286 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  37.19 
 
 		 491 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  39.29 
 
 		 483 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  38.62 
 
 		 483 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  38.41 
 
 		 537 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  40.07 
 
 		 269 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  40 
 
 		 271 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  39.13 
 
 		 285 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  39.16 
 
 		 284 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  34.56 
 
 		 286 aa  163  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  39.41 
 
 		 271 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  44.35 
 
 		 274 aa  163  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  39.41 
 
 		 271 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  39.41 
 
 		 271 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  39.41 
 
 		 271 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  37.64 
 
 		 286 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  39.41 
 
 		 271 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  36.57 
 
 		 275 aa  162  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  38.41 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  38.38 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  39.86 
 
 		 259 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  39.86 
 
 		 259 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  39.86 
 
 		 259 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  40.58 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  40.58 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  39.86 
 
 		 259 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  39.49 
 
 		 259 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  39.86 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  39.86 
 
 		 273 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  38.04 
 
 		 285 aa  159  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  38.55 
 
 		 271 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  39.48 
 
 		 286 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  36.74 
 
 		 279 aa  157  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  37.91 
 
 		 271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  37.91 
 
 		 271 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  37.91 
 
 		 271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  37.91 
 
 		 271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  37.08 
 
 		 558 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  37.91 
 
 		 271 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  38.26 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  37.45 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  37.45 
 
 		 271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  36.3 
 
 		 295 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  42.4 
 
 		 323 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  37.27 
 
 		 285 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  37.68 
 
 		 290 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  37.27 
 
 		 285 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  37.27 
 
 		 285 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  37.18 
 
 		 271 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  36.53 
 
 		 263 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  36 
 
 		 508 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  36.63 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  38.59 
 
 		 251 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  34.98 
 
 		 301 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  36.46 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  37.23 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  39.84 
 
 		 493 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  37.55 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  36.16 
 
 		 318 aa  144  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  35.23 
 
 		 282 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  35.23 
 
 		 282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  35.23 
 
 		 282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  35.23 
 
 		 282 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  35.23 
 
 		 282 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  32.85 
 
 		 267 aa  140  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>