275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4660 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 271 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  61.57 
 
 		 271 aa  328  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  61.51 
 
 		 271 aa  328  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  62.31 
 
 		 271 aa  327  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  60.82 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  61.92 
 
 		 271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  60.38 
 
 		 271 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  61.54 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  61.54 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  61.54 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  61.15 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  58.75 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  58.75 
 
 		 273 aa  311  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  57.2 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  57.59 
 
 		 273 aa  309  4e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  57.2 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  57.2 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  57.2 
 
 		 259 aa  308  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  57.59 
 
 		 273 aa  309  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  56.81 
 
 		 259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  59.61 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  53.67 
 
 		 263 aa  267  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  45.42 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  43.71 
 
 		 301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  49.21 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  44.91 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  40.27 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  39.86 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  40.94 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  41.45 
 
 		 274 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  41.09 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  41.61 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  40.23 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  37.63 
 
 		 301 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  40.23 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  37.76 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  40.5 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  38.13 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  38.95 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  38.6 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  41.6 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  40.36 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  40.22 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  36.55 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  40.08 
 
 		 269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  37.46 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  35.97 
 
 		 282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  40 
 
 		 323 aa  152  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  33.81 
 
 		 310 aa  151  8e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  39.91 
 
 		 251 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  35.25 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 425 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  39.47 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  36.56 
 
 		 382 aa  142  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  37.22 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  36.94 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  39.31 
 
 		 558 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  35.23 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  36.36 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  34.01 
 
 		 303 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  41 
 
 		 265 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  40.54 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  35 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  35 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  35.29 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  36.3 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  35.19 
 
 		 286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  35.76 
 
 		 284 aa  135  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  34.52 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  34.31 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  34.31 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  34.31 
 
 		 285 aa  135  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  37.55 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  36.02 
 
 		 537 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  34.98 
 
 		 286 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  34.94 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  33.79 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  34.03 
 
 		 483 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  34.53 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  33.58 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  35.25 
 
 		 483 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  34.78 
 
 		 286 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  33.57 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  33.68 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  37.97 
 
 		 483 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  35.09 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  38.08 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  35.42 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  35.11 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  35.11 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  35.11 
 
 		 271 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  33.71 
 
 		 286 aa  129  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>