220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1391 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  100 
 
 
254 aa  501  1e-141  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  40.41 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  38.65 
 
 
271 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  39.18 
 
 
271 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  38.25 
 
 
271 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  38.25 
 
 
271 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  38.25 
 
 
271 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  38.25 
 
 
271 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  39.59 
 
 
271 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  39.18 
 
 
271 aa  178  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  40.94 
 
 
271 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  38.78 
 
 
271 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  38.19 
 
 
269 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  39.39 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  38.43 
 
 
273 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  39.24 
 
 
259 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  39.24 
 
 
259 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  39.24 
 
 
259 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  38.43 
 
 
273 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  39.24 
 
 
259 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  38.82 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  37.25 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  37.25 
 
 
273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  37.11 
 
 
263 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  32.55 
 
 
268 aa  119  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  31.05 
 
 
301 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  32.1 
 
 
290 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  30.22 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  35.32 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  32.48 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  30.8 
 
 
310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  29.85 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  30.89 
 
 
284 aa  106  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  29.62 
 
 
285 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  32.2 
 
 
310 aa  102  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  29.23 
 
 
274 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  28.85 
 
 
274 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.3 
 
 
283 aa  99  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  30.66 
 
 
274 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  31.45 
 
 
284 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  31.1 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  30.38 
 
 
275 aa  95.5  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  28.78 
 
 
280 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  29.79 
 
 
274 aa  92.8  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  29.64 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  31.3 
 
 
279 aa  92  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  27.68 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  27.95 
 
 
269 aa  89  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  28.98 
 
 
270 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  31.09 
 
 
382 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  32.73 
 
 
315 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  31 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  30.59 
 
 
292 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  28.2 
 
 
301 aa  87  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  29.41 
 
 
323 aa  86.7  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  31.6 
 
 
296 aa  87  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  31.84 
 
 
301 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  30.66 
 
 
270 aa  85.9  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  28.21 
 
 
318 aa  85.9  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  27.04 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  26.88 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  30.14 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  31.7 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  29.17 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  28.78 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  32.72 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  28.79 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  28.57 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  29.27 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  30.45 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  29.22 
 
 
285 aa  79  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  30.57 
 
 
289 aa  78.6  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  29.48 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  29.33 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  27.57 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  29.33 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  30 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  29.33 
 
 
280 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  28.03 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  28.03 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47526  Probable formate transporter 1 (Formate channel 1)  26.14 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  28.68 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  32.46 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  27.37 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  31.43 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  29.08 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  30.67 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  27.64 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  28.06 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  27.98 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  29.08 
 
 
283 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  26.82 
 
 
303 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  29.08 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  29.08 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  29.08 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  29.08 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  29.08 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  28.51 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>