234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4450 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  75.79 
 
 		 280 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  75.79 
 
 		 280 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  76.43 
 
 		 280 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  73.03 
 
 		 270 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  73.23 
 
 		 281 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  73.88 
 
 		 270 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  72.69 
 
 		 279 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  69.63 
 
 		 270 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  68.59 
 
 		 282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  71.68 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  73.93 
 
 		 281 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  69.49 
 
 		 274 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  70.63 
 
 		 269 aa  400  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  66.31 
 
 		 288 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  70.63 
 
 		 279 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  70.63 
 
 		 279 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  72.24 
 
 		 296 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  71.83 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  66.67 
 
 		 270 aa  386  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  66.19 
 
 		 282 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  77.57 
 
 		 284 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  77.19 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  77.19 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  74.09 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  64.79 
 
 		 270 aa  374  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  67.97 
 
 		 282 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  69.92 
 
 		 277 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  69.29 
 
 		 289 aa  371  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  65.54 
 
 		 270 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  54.72 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  49.81 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  45.45 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  44.56 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  44.44 
 
 		 280 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  41.75 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  39.22 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  38.97 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  39.93 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  37.02 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  37.02 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  38.91 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  35.41 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  36.88 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  34.44 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  34.07 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  33.7 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  38.25 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  33.7 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  30.94 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  31.88 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  31.4 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  31.78 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  32.7 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  30.45 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.58 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  28.22 
 
 		 282 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  32.43 
 
 		 295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  30.03 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  30.39 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  31.51 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  30.11 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  29.47 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  30.8 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  33.7 
 
 		 323 aa  108  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  30.21 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  30.07 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  30.43 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29.82 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  29.82 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29.82 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29.82 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  29.06 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.82 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  29.82 
 
 		 273 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  29.82 
 
 		 273 aa  106  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  29.35 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  29.35 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  29.35 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  29.35 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  29.35 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  29.35 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  28.37 
 
 		 286 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  27.27 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.82 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.82 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  29.35 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  33.09 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  28.42 
 
 		 290 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.28 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  29.01 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  29.73 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  28.71 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  32.72 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  28.16 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  28.77 
 
 		 313 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  28.47 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  26.91 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  29.12 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  29.45 
 
 		 558 aa  92.8  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>