222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0109 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  61.69 
 
 		 272 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  62.07 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  41.92 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  38.91 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  37.74 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  37.55 
 
 		 280 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  36.86 
 
 		 270 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  38.13 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  36.47 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  37.21 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  34.62 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  36.08 
 
 		 282 aa  172  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  35.29 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  36.08 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  34.12 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  34.62 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  35 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  33.58 
 
 		 275 aa  169  8e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  34.9 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  32.96 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  36.47 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  33.7 
 
 		 274 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  35.69 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  35.69 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  37.25 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  37.25 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  37.25 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  32.96 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  36.47 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  35 
 
 		 285 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  34.5 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  33.71 
 
 		 283 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  40.54 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  35.29 
 
 		 279 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  33.59 
 
 		 277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  35.63 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  35.63 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  35.63 
 
 		 284 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  33.33 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  33.33 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  32.96 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  34.9 
 
 		 281 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  34.5 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  36.08 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  33.09 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  31.78 
 
 		 270 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  32.22 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  31.34 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  33.82 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  30.37 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  39.64 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  31.01 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  37.91 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  31.7 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.95 
 
 		 289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  34.09 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  30.97 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  34.73 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  32.83 
 
 		 280 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  30.69 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  31.77 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  29.67 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  31.91 
 
 		 323 aa  106  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  29.39 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  31.7 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  30.84 
 
 		 251 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  29.75 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  29.75 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  28.52 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  29.75 
 
 		 285 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  30.52 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  30.52 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  29.86 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  27.44 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  26.12 
 
 		 271 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29.28 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29.28 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29.28 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  26.87 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  27.07 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  29.28 
 
 		 259 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  27.07 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  28.2 
 
 		 269 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  27.65 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  27.65 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  26.69 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  27.65 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.28 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  30.83 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.72 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  27.65 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.72 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  29.75 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  26.81 
 
 		 292 aa  92.4  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  27.97 
 
 		 289 aa  92.4  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>