239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3583 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  96.7 
 
 
273 aa  529  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  96.7 
 
 
273 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  98.07 
 
 
259 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  97.68 
 
 
259 aa  508  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  98.07 
 
 
259 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  97.68 
 
 
259 aa  507  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  98.07 
 
 
259 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  57.59 
 
 
271 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  57.92 
 
 
271 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  57.53 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  57.87 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  57.14 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  58.27 
 
 
271 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  57.87 
 
 
271 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  57.48 
 
 
271 aa  301  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  57.48 
 
 
271 aa  301  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  57.48 
 
 
271 aa  301  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  57.48 
 
 
271 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  57.48 
 
 
269 aa  290  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  49.03 
 
 
263 aa  237  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  43.75 
 
 
267 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  39.38 
 
 
301 aa  191  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  41.04 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  37.64 
 
 
285 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  38.55 
 
 
278 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  38.43 
 
 
254 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  37.89 
 
 
261 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  36.64 
 
 
290 aa  148  9e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  38.91 
 
 
425 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  37.79 
 
 
270 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  36.82 
 
 
292 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  35.87 
 
 
310 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.77 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  33.78 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  36.81 
 
 
290 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  34.01 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.58 
 
 
282 aa  133  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  35.02 
 
 
301 aa  132  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  34.89 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  32.13 
 
 
286 aa  128  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  34.07 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  34.43 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  33.11 
 
 
316 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  33.09 
 
 
284 aa  125  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  32.96 
 
 
275 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  33.73 
 
 
269 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  33.78 
 
 
289 aa  123  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  31.82 
 
 
310 aa  122  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  32.51 
 
 
286 aa  122  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.56 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  32.02 
 
 
268 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  31.01 
 
 
303 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  31.01 
 
 
303 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  31.01 
 
 
303 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  32.97 
 
 
483 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  32.25 
 
 
483 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  32.13 
 
 
558 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  35.05 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.59 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  30.8 
 
 
483 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  33.33 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  32.95 
 
 
265 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  30.55 
 
 
285 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  30.55 
 
 
285 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  30.55 
 
 
285 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  29.62 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  32.71 
 
 
279 aa  112  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  30 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  32.71 
 
 
537 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  30.22 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  33.61 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  29.14 
 
 
282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  30.22 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  33.63 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  30.22 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  30.22 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  34.85 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  32.91 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  29.24 
 
 
285 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  28.68 
 
 
279 aa  110  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  33.45 
 
 
274 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  29.1 
 
 
295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  28.99 
 
 
282 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  30.07 
 
 
282 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  28.99 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  29.89 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  31.92 
 
 
289 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  30.8 
 
 
296 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 
382 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  29.04 
 
 
274 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  29.96 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  29.5 
 
 
286 aa  106  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  29.96 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  29.96 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  29.96 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  29.96 
 
 
285 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>