217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2227 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  60.7 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  42.28 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  42.31 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  40.51 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  37.01 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  39.75 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  31.89 
 
 		 283 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  31.89 
 
 		 283 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  32.16 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  37.66 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  31.5 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  35.06 
 
 		 289 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  38.67 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  35.06 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  38.22 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  38.22 
 
 		 268 aa  125  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  34.69 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  36.61 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  33.48 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  34.9 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  31.45 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  34.9 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  35.56 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  35.56 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  33.85 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  30.15 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  32.81 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  31.58 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  32.81 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  32.38 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  32.81 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  32.81 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  31.99 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  32.41 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  32.41 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  32.41 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  31.98 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  32.41 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  30.45 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  32.02 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  36.12 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  29.7 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  29.32 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  29.32 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  29.32 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  29.32 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  29.32 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  32.64 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  29.27 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  32.03 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  34.12 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  29.27 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  32.22 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  28.32 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  26.33 
 
 		 483 aa  93.2  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  27.61 
 
 		 483 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  29.36 
 
 		 285 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  29.59 
 
 		 261 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  30 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  26.47 
 
 		 262 aa  89.4  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  26.69 
 
 		 483 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  31.84 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  30.05 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  27.98 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  30.14 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  28.78 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  26.72 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  28.78 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  31.27 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  30.86 
 
 		 286 aa  85.5  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  27.24 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  29.77 
 
 		 315 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  27.14 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  27.23 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  30.17 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  26.52 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  32.68 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  26.52 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  30.43 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  31.1 
 
 		 425 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  28.69 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>