213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1997 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 		 273 aa  546  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2427  formate/nitrite transporter  77.66 
 
 		 274 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000401704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2475  formate/nitrite transporter  77.66 
 
 		 274 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000187087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0288  formate/nitrite transporter  47.62 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0295  formate/nitrite transporter  47.62 
 
 		 281 aa  244  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  30.31 
 
 		 276 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  31.76 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1449  formate/nitrite transporter  26.67 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.748577  normal  0.576318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  29.5 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  28.19 
 
 		 310 aa  105  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  27.84 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  28.24 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  28.74 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  28.35 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.58 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  28.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  28.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  28.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  28.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  28.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  27.97 
 
 		 274 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  27.82 
 
 		 537 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  29.12 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  31.05 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 		 274 aa  95.5  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  28.15 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  26.82 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  26.91 
 
 		 285 aa  92.4  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  31.65 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  32.62 
 
 		 494 aa  90.1  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  28.63 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  28.22 
 
 		 558 aa  89.4  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  28.63 
 
 		 268 aa  89.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  28.63 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  27.84 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  31.43 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  33.15 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  33.15 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  29.22 
 
 		 508 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  32.58 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  24.7 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  27.24 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  32.58 
 
 		 324 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  30.61 
 
 		 271 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  30.61 
 
 		 271 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  26.46 
 
 		 267 aa  85.5  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  27.54 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  27.24 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  26.9 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  30.37 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  30.61 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  30.61 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  26.85 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  30.61 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  28.72 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34810  formate/nitrite transporter family protein  29.36 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  29.44 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  31.63 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  29.03 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  29.85 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  27.45 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  30.9 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  30.9 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  29.13 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  30.9 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  30.9 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  27.61 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  29.5 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  29.5 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  27.61 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  29.13 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  27.61 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  27.61 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  28.89 
 
 		 493 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  27 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  27.13 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  28.69 
 
 		 483 aa  79  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  27.5 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  28.69 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  26.92 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  26.92 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  25.86 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  26.92 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  26.92 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  28.74 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  29.81 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.56 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.56 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  25.9 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  24.38 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  28.57 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  28.57 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  28.57 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  26.2 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  27.36 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>