224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01040 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 		 279 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  66.04 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  50.19 
 
 		 301 aa  242  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  46.98 
 
 		 287 aa  238  5.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  40.42 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  39.31 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  40.29 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  39.47 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  39.42 
 
 		 265 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  37.41 
 
 		 286 aa  181  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  37.41 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  38.6 
 
 		 285 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  37 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  36.69 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  39.11 
 
 		 558 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  39.13 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  38.04 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  37.83 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  34.67 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  37.83 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  37.83 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  37.83 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  37.83 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  37.89 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  38.41 
 
 		 286 aa  167  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  37.32 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  38.29 
 
 		 491 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  38.66 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  39.77 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  36.2 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  38.93 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  35.82 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  35.71 
 
 		 537 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  33.58 
 
 		 483 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  35.96 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  35.04 
 
 		 483 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  38.35 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  37.97 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  33.94 
 
 		 483 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  38.66 
 
 		 289 aa  148  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  38.68 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  37.59 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  38.27 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  35.71 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  37.86 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  37.77 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  37.77 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  40.28 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  40.28 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  37.86 
 
 		 324 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  36.87 
 
 		 494 aa  142  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  35.69 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  40.54 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  33.84 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  33.71 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  33.71 
 
 		 282 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0550252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  33.71 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  33.71 
 
 		 282 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  33.84 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  33.09 
 
 		 282 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  32.85 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  35.65 
 
 		 493 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  36.74 
 
 		 425 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  34.38 
 
 		 508 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  38.14 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  35.16 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2864  formate/nitrite transporter  35.59 
 
 		 234 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.666076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  37.45 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.52 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  33.59 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  35.71 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  35.25 
 
 		 285 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  33.58 
 
 		 310 aa  125  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  37.01 
 
 		 315 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  36.21 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  32.69 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  33.21 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  34.94 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  35.9 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  35.68 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  35.68 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  35.68 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  35.68 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  35.68 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  34.16 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  34.58 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  34.85 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  34.14 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>