231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1429 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  100 
 
 		 265 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  91.32 
 
 		 265 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  51.59 
 
 		 252 aa  261  6.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  51.78 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  38.89 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  37.74 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  37.16 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  36.78 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  38.31 
 
 		 268 aa  179  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  37.26 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  37.93 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  37.93 
 
 		 268 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  36.02 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  35.42 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  35.42 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  35.42 
 
 		 283 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  36.02 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  36.02 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  38.67 
 
 		 269 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  38.67 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  38.78 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  38.28 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  38.28 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  38.28 
 
 		 269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  38.4 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  38.4 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  38.4 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  38.4 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  39.02 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  38.4 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  35.25 
 
 		 283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  39.02 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  38.4 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  37.02 
 
 		 269 aa  171  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  36.33 
 
 		 277 aa  171  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  36.9 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  40.51 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  37.72 
 
 		 285 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  40.54 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  35.77 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  36.33 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  35.71 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  31.97 
 
 		 301 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  35.68 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  32.57 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  34.42 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  36.41 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.45 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  35.37 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  35.8 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  36.95 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  37.35 
 
 		 292 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  35.11 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.62 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  33.6 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  31.3 
 
 		 316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  33.2 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  32.41 
 
 		 483 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  32.16 
 
 		 483 aa  109  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  31.97 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  32.4 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  33.2 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  32.4 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  31.98 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  31.87 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  34.09 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  32 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  32 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  32 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  32 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  32.8 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  36 
 
 		 425 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  33.99 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  33.99 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  34.31 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  33.99 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  31.97 
 
 		 382 aa  104  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  33.99 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  33.6 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  32.85 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  35.51 
 
 		 558 aa  103  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  33.96 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.7 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  32.68 
 
 		 275 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  33.48 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.5 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  32.81 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  32.81 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  32.41 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  32.41 
 
 		 273 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  33.49 
 
 		 537 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  31.47 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  31.02 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.33 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  31.38 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  31.1 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 274 aa  95.9  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  31.09 
 
 		 284 aa  95.1  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  33.81 
 
 		 324 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>