258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3777 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  100 
 
 
271 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  96.68 
 
 
271 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  94.46 
 
 
271 aa  513  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  95.2 
 
 
271 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  95.57 
 
 
271 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  95.2 
 
 
271 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  95.2 
 
 
271 aa  512  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  95.2 
 
 
271 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  95.2 
 
 
271 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  93.36 
 
 
271 aa  508  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  80.74 
 
 
269 aa  417  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  60.82 
 
 
271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  58.3 
 
 
273 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  58.3 
 
 
273 aa  308  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  57.92 
 
 
273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  57.92 
 
 
273 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  57.53 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  57.53 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  57.53 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  57.53 
 
 
259 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  57.14 
 
 
259 aa  300  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  47.57 
 
 
267 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  46.74 
 
 
263 aa  221  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  41.33 
 
 
285 aa  205  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  42.75 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  40.41 
 
 
301 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  39.59 
 
 
254 aa  178  8e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  40.2 
 
 
293 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  40.22 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  38.1 
 
 
278 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  39.86 
 
 
274 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  39.41 
 
 
275 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  34.98 
 
 
284 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  38.06 
 
 
261 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  34.84 
 
 
301 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  37.96 
 
 
310 aa  148  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  40.22 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  35.42 
 
 
292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  36.14 
 
 
290 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  38.46 
 
 
280 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  36.92 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  36.96 
 
 
382 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  34.14 
 
 
295 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.4 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  35.44 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
425 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  35.91 
 
 
323 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  35 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  34.6 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  32.85 
 
 
279 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  37.14 
 
 
289 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  36.8 
 
 
315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  36.17 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  33.84 
 
 
310 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  32.97 
 
 
282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  35.83 
 
 
269 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  32.52 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  35.38 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  33.44 
 
 
313 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  33.57 
 
 
558 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  34.22 
 
 
287 aa  123  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  33.33 
 
 
265 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.51 
 
 
301 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  33.21 
 
 
284 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  33.21 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  33.45 
 
 
483 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  33.58 
 
 
296 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  32.28 
 
 
282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  32.21 
 
 
275 aa  119  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  33.98 
 
 
491 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  32.47 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  32.5 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  32.65 
 
 
483 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  31.34 
 
 
286 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  35.43 
 
 
494 aa  115  5e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  33.33 
 
 
483 aa  115  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  38.04 
 
 
324 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  32.45 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  33.96 
 
 
537 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  30.94 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  32.2 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  32.2 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  36.96 
 
 
324 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  29.83 
 
 
295 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  32.76 
 
 
508 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  34.27 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  36.96 
 
 
324 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  32.71 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  31.72 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  33.6 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  36.96 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  30.4 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  37.7 
 
 
493 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  31.99 
 
 
303 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  35.87 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  35.87 
 
 
330 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  32.01 
 
 
286 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  35.87 
 
 
330 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  29.24 
 
 
303 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>