222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2136 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 295 aa  578  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  75.25 
 
 		 290 aa  444  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  68.65 
 
 		 290 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  57.14 
 
 		 284 aa  309  5e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  50.94 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  48.14 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  47.8 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  45.97 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  46.78 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  46.23 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  47.8 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  38.73 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  37.7 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  38.98 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.55 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  37.54 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  38.37 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  36.46 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  36.55 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  38.59 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  36.77 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  43.04 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  38 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  35.57 
 
 		 285 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  38.13 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  35.93 
 
 		 263 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  34.8 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  34.83 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  34.03 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  34.03 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  34.03 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  34.03 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  34.14 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  33.78 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  33.78 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  33.78 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  33.68 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  33.78 
 
 		 259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  32.54 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.18 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  33.78 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  33.78 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  34.14 
 
 		 271 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  33.45 
 
 		 259 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  34.34 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  34.14 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  34.34 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  33.8 
 
 		 280 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  33.79 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  34.83 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  41.74 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  31.27 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  34.8 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  33.67 
 
 		 316 aa  133  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  33.1 
 
 		 425 aa  132  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  34.46 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  29.21 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  37.02 
 
 		 323 aa  125  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  33.1 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  33.1 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  33.44 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  32.54 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  32.43 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  34.62 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  31.77 
 
 		 303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  31.67 
 
 		 303 aa  119  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  36.21 
 
 		 301 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  32.43 
 
 		 270 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  32.42 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  32.42 
 
 		 279 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  32.06 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  31.63 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  36.57 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  34.14 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  30.22 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  33.22 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  31.86 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  32.2 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  32.64 
 
 		 296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  29.47 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  32.48 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  30.27 
 
 		 282 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  30 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  31.54 
 
 		 295 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  31.93 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  31.93 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  29.07 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  31.93 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  30.74 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  32.39 
 
 		 270 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>