235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1131 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 279 aa  554  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 279 aa  554  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  82.02 
 
 		 270 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  80.67 
 
 		 269 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  79.48 
 
 		 270 aa  434  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  79.85 
 
 		 282 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  79.21 
 
 		 279 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  76.26 
 
 		 281 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  84.39 
 
 		 281 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  77.99 
 
 		 270 aa  425  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  74.91 
 
 		 288 aa  424  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  76.64 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  76.03 
 
 		 274 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  71.91 
 
 		 270 aa  409  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  68.89 
 
 		 270 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  73.03 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  71.96 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  73.03 
 
 		 280 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  69.96 
 
 		 296 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  70.63 
 
 		 285 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  73 
 
 		 284 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  71.54 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  67.97 
 
 		 282 aa  364  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  69.81 
 
 		 277 aa  366  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  71.02 
 
 		 284 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  71.02 
 
 		 284 aa  359  3e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  67.04 
 
 		 270 aa  358  6e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  70.67 
 
 		 284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  69.42 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  62.92 
 
 		 289 aa  326  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  55.64 
 
 		 270 aa  295  8e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  49.63 
 
 		 283 aa  274  9e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  45.76 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  42.49 
 
 		 295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  39.05 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  41.48 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  36.84 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  40.22 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  37.67 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  38.01 
 
 		 303 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  38.01 
 
 		 303 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  38.52 
 
 		 275 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  40.53 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  31.42 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  33.22 
 
 		 301 aa  152  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  31.42 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  34.09 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  35.41 
 
 		 306 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  32.95 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  30.55 
 
 		 274 aa  146  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  34.88 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  35.98 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  31.18 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  35.02 
 
 		 271 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  32.42 
 
 		 295 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  30.85 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  31.36 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  29.41 
 
 		 282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  31.88 
 
 		 289 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  29.6 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  30.5 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  32.44 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  28.94 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  32.36 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  27.93 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  29.79 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  27.42 
 
 		 293 aa  106  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  32.29 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  31.21 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  30.77 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  29.01 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  28.92 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  29.33 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  28.92 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  30.26 
 
 		 280 aa  96.3  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  28.62 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  27.87 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  27.56 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  27.82 
 
 		 271 aa  94  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  28.52 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  26.86 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  26.86 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  26.86 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  29.45 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  26.86 
 
 		 271 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  31.34 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  26.42 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  29.39 
 
 		 558 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  27.11 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  27.11 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  26.77 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  26.77 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  26.77 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  26.47 
 
 		 259 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  32.49 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  26.47 
 
 		 259 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  26.77 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  26.77 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>