231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46427 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  100 
 
 		 315 aa  622  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  45.8 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  39.92 
 
 		 261 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  39.25 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  40.22 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  40.24 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  39.49 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  37.28 
 
 		 275 aa  160  4e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  37.09 
 
 		 274 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  36.36 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  36.43 
 
 		 283 aa  157  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  42.13 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  39.47 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  40.6 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  37.45 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  38.55 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  36.09 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  38.03 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  36.74 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  36.33 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  35.74 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  35.74 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  36.72 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  35.74 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  36.36 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  35.74 
 
 		 271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  35.36 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  39.46 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  35.94 
 
 		 271 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  36.58 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  34.57 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  39.08 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  35.92 
 
 		 303 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  35.87 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  35.94 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  36.29 
 
 		 263 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  37.12 
 
 		 285 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  35.51 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  34.97 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  35.61 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  34.94 
 
 		 558 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  34.97 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  31.6 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  34.97 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  35.69 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  35.16 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  35.16 
 
 		 303 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  35.52 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  35.66 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  33.45 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  36.46 
 
 		 286 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  32.84 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  36.47 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  36.4 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  35.17 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  36.2 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  35.36 
 
 		 425 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  35.19 
 
 		 313 aa  129  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  32.17 
 
 		 290 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  36.26 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.12 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  35.18 
 
 		 289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  35.02 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  31.7 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  32.47 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  32.32 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  35.32 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  33.92 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  34.48 
 
 		 269 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  32.07 
 
 		 286 aa  126  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  34.39 
 
 		 537 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  35.29 
 
 		 285 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  33.46 
 
 		 483 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  34.21 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  32.41 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  33.98 
 
 		 269 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  33.45 
 
 		 491 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  32.68 
 
 		 273 aa  123  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  32.68 
 
 		 273 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  37.59 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  34.32 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  31.42 
 
 		 273 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  31.42 
 
 		 273 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  34.07 
 
 		 318 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  32.02 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  32.02 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  32.02 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  32.02 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  33.08 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  33.46 
 
 		 483 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  35.85 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  32.97 
 
 		 275 aa  119  9e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>