245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01852 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  93.36 
 
 
286 aa  551  1e-156  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  78.57 
 
 
303 aa  462  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  60.07 
 
 
286 aa  359  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  57.3 
 
 
285 aa  338  9e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  55.52 
 
 
285 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  56.58 
 
 
285 aa  329  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  56.58 
 
 
285 aa  329  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  56.58 
 
 
285 aa  329  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  54.8 
 
 
285 aa  324  1e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  56.67 
 
 
271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  55.16 
 
 
285 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  56.67 
 
 
271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  56.67 
 
 
271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  56.67 
 
 
271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  56.67 
 
 
271 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  55.67 
 
 
286 aa  322  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  56.23 
 
 
286 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  56.07 
 
 
289 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  55.52 
 
 
286 aa  305  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  53.36 
 
 
483 aa  296  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  53.11 
 
 
483 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  51.65 
 
 
483 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  54.79 
 
 
491 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  49.64 
 
 
275 aa  286  4e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  52.87 
 
 
537 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  53.26 
 
 
558 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  53.76 
 
 
508 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  54.04 
 
 
330 aa  263  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  55.56 
 
 
330 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  55.56 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  54.21 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  55.56 
 
 
330 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  54.21 
 
 
324 aa  261  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  54.21 
 
 
324 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  54.62 
 
 
324 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  51.64 
 
 
494 aa  255  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  52.06 
 
 
493 aa  249  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  43.93 
 
 
282 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  43.17 
 
 
282 aa  246  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  43.17 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  43.17 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  43.17 
 
 
282 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  43.17 
 
 
282 aa  245  6e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  43.32 
 
 
282 aa  245  6e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  43.32 
 
 
282 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  44.98 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  41.28 
 
 
296 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  41.73 
 
 
316 aa  217  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1500  formate transporter  46.56 
 
 
547 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2864  formate/nitrite transporter  42.92 
 
 
234 aa  195  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.666076  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  41.61 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  38.85 
 
 
318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  37.41 
 
 
279 aa  181  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  37.59 
 
 
301 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  39.29 
 
 
269 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  36.03 
 
 
278 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  38.46 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  37.54 
 
 
293 aa  165  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  35.16 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  36.82 
 
 
270 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  37.63 
 
 
265 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.69 
 
 
282 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  39.71 
 
 
425 aa  152  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  33.57 
 
 
269 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  34.51 
 
 
292 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  36.08 
 
 
280 aa  143  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  32.53 
 
 
301 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  34.52 
 
 
271 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  31.58 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  34.31 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  32.49 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  31.58 
 
 
310 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  34.56 
 
 
290 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  30.04 
 
 
323 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  31.21 
 
 
259 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  31.21 
 
 
259 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  31.21 
 
 
259 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  31.56 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  31.21 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  31.56 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  31.21 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  34.72 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  31.56 
 
 
273 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  31.56 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  32.98 
 
 
290 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  31.91 
 
 
289 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  33.56 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  31.32 
 
 
284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  34.52 
 
 
288 aa  113  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  31.13 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  32.09 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>