230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1065 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00908  formate transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  91.58 
 
 
285 aa  538  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  95.94 
 
 
271 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  95.57 
 
 
271 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  95.57 
 
 
271 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  95.57 
 
 
271 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  95.57 
 
 
271 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  83.86 
 
 
286 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  82.46 
 
 
285 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  82.46 
 
 
285 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  82.46 
 
 
285 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  81.05 
 
 
286 aa  480  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  77.89 
 
 
285 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  82.11 
 
 
286 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  79.65 
 
 
285 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  63.38 
 
 
286 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  57.3 
 
 
286 aa  338  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  58.01 
 
 
286 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  57.2 
 
 
275 aa  332  6e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  54.51 
 
 
303 aa  318  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  59.64 
 
 
289 aa  318  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  51.67 
 
 
483 aa  282  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  50.18 
 
 
282 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  50.18 
 
 
282 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  50.18 
 
 
282 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  50.18 
 
 
282 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  50.35 
 
 
282 aa  281  9e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  49.46 
 
 
483 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  50.19 
 
 
483 aa  279  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  49.82 
 
 
282 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  50 
 
 
282 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  52.09 
 
 
558 aa  278  8e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  49.65 
 
 
282 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  53.41 
 
 
491 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  55.6 
 
 
330 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  55.6 
 
 
330 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  55.6 
 
 
330 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  55.6 
 
 
330 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  55.21 
 
 
324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  55.98 
 
 
324 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  54.83 
 
 
324 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  54.83 
 
 
324 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  50.38 
 
 
537 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  52.63 
 
 
494 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  49.82 
 
 
493 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  46.62 
 
 
296 aa  241  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  47.94 
 
 
508 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2864  formate/nitrite transporter  50.22 
 
 
234 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.666076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  40.43 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  39.06 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1500  formate transporter  44.22 
 
 
547 aa  186  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  37.5 
 
 
278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  38.19 
 
 
287 aa  178  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  39.35 
 
 
318 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  38.6 
 
 
279 aa  177  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  41.28 
 
 
301 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  38.52 
 
 
301 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  39.44 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  37.15 
 
 
282 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  36.7 
 
 
293 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  37.28 
 
 
265 aa  158  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  36.67 
 
 
310 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  36.56 
 
 
269 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  36.4 
 
 
270 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.59 
 
 
280 aa  142  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
425 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  35.84 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  32.2 
 
 
301 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  36.68 
 
 
261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  35.09 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  31.29 
 
 
263 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  31.91 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  31.62 
 
 
290 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  35.02 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  30.93 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  32.36 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  28.62 
 
 
310 aa  112  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  30 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  28.98 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  30.34 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  28.67 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  30.69 
 
 
274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  30.8 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29.96 
 
 
259 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 
259 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29.96 
 
 
259 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29.96 
 
 
259 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  30.24 
 
 
280 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.47 
 
 
289 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29.96 
 
 
259 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29.96 
 
 
273 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29.96 
 
 
273 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>