239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2663 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  100 
 
 
283 aa  564  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  45.77 
 
 
284 aa  246  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  43.31 
 
 
279 aa  228  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  39.62 
 
 
270 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  39.56 
 
 
274 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  39.44 
 
 
282 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  40.94 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  41.18 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  41.18 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  41.05 
 
 
295 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  39.01 
 
 
281 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  37.28 
 
 
288 aa  205  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  38.81 
 
 
270 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  41.42 
 
 
277 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  39.55 
 
 
270 aa  202  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  36.84 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  37.32 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  36.84 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  38.06 
 
 
270 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  43.64 
 
 
272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  36.14 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  40.67 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  41.05 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  38.15 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  41.05 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  41.05 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  40.42 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  39.93 
 
 
274 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  40.07 
 
 
275 aa  194  9e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  42.8 
 
 
272 aa  195  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  40 
 
 
296 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  37.41 
 
 
279 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  38.18 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  39.22 
 
 
285 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  37.74 
 
 
306 aa  188  8e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  36.94 
 
 
274 aa  188  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  35.61 
 
 
284 aa  188  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  41.7 
 
 
281 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  39.93 
 
 
274 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  37.68 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  38.02 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  39.93 
 
 
270 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  38.43 
 
 
289 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  35.64 
 
 
283 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  36.49 
 
 
284 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  36.49 
 
 
284 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  36.49 
 
 
284 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  36.36 
 
 
309 aa  175  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  35.9 
 
 
275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  38.78 
 
 
289 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  42.01 
 
 
274 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  34.51 
 
 
290 aa  158  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  34.74 
 
 
301 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  36.14 
 
 
290 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  35.97 
 
 
284 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  37.46 
 
 
271 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  36.36 
 
 
289 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  36.43 
 
 
315 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  33.85 
 
 
296 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  37.21 
 
 
323 aa  142  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  32.18 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  33.1 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  32.4 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  36.36 
 
 
251 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  37.07 
 
 
261 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  32.4 
 
 
271 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  32.06 
 
 
271 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  32.4 
 
 
271 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  31.36 
 
 
271 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  32.06 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  32.06 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  32.06 
 
 
271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  32.06 
 
 
271 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  34.28 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  32.32 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  33.72 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  33.72 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  30.6 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  33.33 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  33.33 
 
 
273 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  32.95 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  32.95 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  32.95 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  31.64 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  32.95 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  30.47 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  32.08 
 
 
259 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  33.05 
 
 
270 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  29.74 
 
 
263 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  29.89 
 
 
269 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  32.84 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  31.39 
 
 
278 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  28.98 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  31.41 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  31.41 
 
 
283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  29.21 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  31.05 
 
 
283 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  32.09 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  28.67 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>