235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3480 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 288 aa  578  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  88.39 
 
 		 269 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  85.09 
 
 		 282 aa  475  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  80.9 
 
 		 274 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  76.16 
 
 		 282 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  77.54 
 
 		 281 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  76.95 
 
 		 270 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  77.99 
 
 		 270 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  77.15 
 
 		 270 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  76.95 
 
 		 270 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  74.91 
 
 		 279 aa  424  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  74.91 
 
 		 279 aa  424  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  74.55 
 
 		 279 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  71.38 
 
 		 270 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  79.03 
 
 		 281 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  69.34 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  71.11 
 
 		 284 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  69.2 
 
 		 296 aa  381  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  73.23 
 
 		 270 aa  381  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  66.31 
 
 		 285 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  72.36 
 
 		 284 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  68.09 
 
 		 282 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  72.36 
 
 		 284 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  70.79 
 
 		 280 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  72.36 
 
 		 284 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  70.79 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  70.79 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  69.66 
 
 		 277 aa  365  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  68.79 
 
 		 309 aa  362  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  63.67 
 
 		 289 aa  340  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  55.39 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  51.89 
 
 		 283 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  42.66 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  44.07 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  41.64 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  42.52 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  37.28 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  37.46 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  37.46 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  37.46 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  37.58 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  37.04 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  35.41 
 
 		 301 aa  161  9e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 274 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  32.95 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  34.9 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  39.78 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  33.72 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  34.5 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  33.46 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  31.73 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  33.79 
 
 		 310 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  32.76 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  34.63 
 
 		 271 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  33.94 
 
 		 284 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  31.83 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  32.85 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  33.47 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  31.18 
 
 		 270 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  32.57 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  29.35 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  32.44 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  30.34 
 
 		 271 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  31.6 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  30 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  31.18 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  29.66 
 
 		 271 aa  105  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  33.64 
 
 		 315 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  30.28 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.6 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  30.28 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  30.28 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  30.28 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  29.89 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  30.28 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  26.98 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  29 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  29 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  30.74 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  28.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  29.12 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  28.97 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  29 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  29 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  29 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  29 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  29 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  29 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  29 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  31.03 
 
 		 558 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  28.03 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  29.14 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  27.97 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  30.15 
 
 		 280 aa  96.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  32.14 
 
 		 269 aa  95.9  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  28.79 
 
 		 508 aa  95.5  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  26.98 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  29.39 
 
 		 537 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>