221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3094 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  49.8 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  45.02 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  40.08 
 
 		 280 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  39.61 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  35.47 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  34.81 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  35.74 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  35.74 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  37.26 
 
 		 285 aa  165  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  36.97 
 
 		 270 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  35.98 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  35.83 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  36.19 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  33.97 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  34.47 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  34.47 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  34.1 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  36.43 
 
 		 296 aa  155  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  35.69 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  34.98 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  37.02 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  34.24 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  34.83 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  35.8 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  35.82 
 
 		 309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  36.19 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  32.47 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  35.98 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  36.19 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  35.21 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  34.72 
 
 		 283 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  33.85 
 
 		 283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  39.92 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  34.53 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  32.21 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  32.21 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  34.81 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  34.6 
 
 		 282 aa  142  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  38.27 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  34.44 
 
 		 284 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  34.44 
 
 		 284 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  35.83 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  33.46 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  31.12 
 
 		 306 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  34.62 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  37.33 
 
 		 272 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  34.59 
 
 		 275 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  32.47 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  31.84 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  31.72 
 
 		 274 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  31.42 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  33.02 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  31.9 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  33.49 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  33.49 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  33.02 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  32.55 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  32.55 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  32.55 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  32.55 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  32.55 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  32.55 
 
 		 271 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  29.93 
 
 		 271 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  28.52 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  30.51 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  31.77 
 
 		 315 aa  93.6  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  31.06 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  26.45 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  29.97 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  31.65 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  28 
 
 		 310 aa  89.7  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  33.62 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  35 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  29.43 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  27.91 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  32.09 
 
 		 295 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  27.96 
 
 		 558 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  27.4 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  26.46 
 
 		 268 aa  86.7  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  27.52 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  28.14 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  27.24 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  27.52 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  27.52 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  27.52 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  27.52 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  27.52 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  27.56 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  28.74 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  27.6 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  27.3 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  28.41 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  28.42 
 
 		 303 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  26.44 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  27.24 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  28.93 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  26.3 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>