216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3006 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  94.12 
 
 		 272 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  62.07 
 
 		 306 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  41.31 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  41.29 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  37.98 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  34.85 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  36.72 
 
 		 295 aa  161  8.000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  35.02 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  33.98 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  34.88 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  33.58 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  33.96 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  35.27 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  31.37 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 275 aa  151  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  34.5 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  35.93 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  35.56 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  33.71 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  35.56 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  35.66 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  33.21 
 
 		 289 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  41.38 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  34.5 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  34.5 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  32.31 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  34.77 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  35 
 
 		 284 aa  141  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  31.68 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  34.18 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  33.2 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  37.02 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  33.72 
 
 		 296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 270 aa  133  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  30.13 
 
 		 270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  34.32 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  31.78 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  36.1 
 
 		 284 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  29.57 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  36.1 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  36.1 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  35.07 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  31.76 
 
 		 289 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  35.12 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  35.12 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  35.12 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  32.61 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  30.07 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  34.25 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  30.42 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  30.69 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  33.64 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  32.97 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  29.12 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  31.37 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  30.11 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  29.2 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  31.29 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  30.13 
 
 		 251 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  29.69 
 
 		 275 aa  95.9  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  27.04 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  29.21 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.92 
 
 		 289 aa  92  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  26.69 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  28.81 
 
 		 310 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  31.12 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  31.12 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  31.12 
 
 		 285 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  32.1 
 
 		 286 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  28.89 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  29.08 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  31.47 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  28.68 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  28.68 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  29.39 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  28.68 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  29.68 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  29 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  28.31 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  30.94 
 
 		 286 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  27.21 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  30.32 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  30.4 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  28.31 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  27.54 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  27.94 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  29 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>