264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1605 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 289 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  54.42 
 
 		 285 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  46.76 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  48.29 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  41.91 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  42.59 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  42.75 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  42.59 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  42.59 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  43.12 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  42.59 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  42.59 
 
 		 271 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  42.38 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  42.59 
 
 		 271 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  41.26 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  41.42 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  41.42 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  41.04 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  41.04 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  41.31 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  40.3 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  40.3 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  40.3 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  40.3 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  41.89 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  39.93 
 
 		 259 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  38.78 
 
 		 292 aa  178  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  38.85 
 
 		 269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  41.04 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  38.85 
 
 		 284 aa  172  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  41.61 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  39.73 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  37.36 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  38.38 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  37.24 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  35.04 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  38.41 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  43.26 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  34.67 
 
 		 283 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  38 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  39.55 
 
 		 279 aa  149  7e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  35.4 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  36.1 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  36.43 
 
 		 313 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  36.2 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  39.05 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  36.68 
 
 		 290 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  37.09 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  42.16 
 
 		 318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  38.46 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  42.91 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  40.75 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  34.21 
 
 		 261 aa  136  5e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  41.47 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  36.92 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  36.5 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  35.77 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  34.36 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  33.82 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  34.18 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  34.18 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  38.08 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  32.59 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  31.23 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  38.37 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  34.58 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  35.54 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  34.38 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  32.22 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  30.04 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  34.16 
 
 		 286 aa  122  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  31.35 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  32.45 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  28.26 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  32.75 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.91 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  32.99 
 
 		 286 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  33.09 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  30.66 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  31.97 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  31.88 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  33.1 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  31.48 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  34.78 
 
 		 558 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  35.55 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  30.88 
 
 		 270 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  34.25 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  30.48 
 
 		 270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  35.83 
 
 		 289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  33.45 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  32.17 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  32.17 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  34.26 
 
 		 537 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  32.07 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  32.07 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  30.32 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  30.74 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  35.83 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  37.18 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>