221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3845 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  100 
 
 		 269 aa  538  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  99.63 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  96.65 
 
 		 269 aa  520  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  97.03 
 
 		 269 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  96.65 
 
 		 289 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  92.13 
 
 		 268 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  92.13 
 
 		 268 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  92.51 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  92.51 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  92.13 
 
 		 268 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  92.51 
 
 		 268 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  92.13 
 
 		 268 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  92.13 
 
 		 268 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  91.76 
 
 		 268 aa  494  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  88.43 
 
 		 269 aa  484  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  87.69 
 
 		 266 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  83.91 
 
 		 268 aa  454  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  83.91 
 
 		 268 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  83.52 
 
 		 268 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  42.63 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  38.28 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  41.94 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  39.1 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  39.18 
 
 		 283 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  38.35 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  38.01 
 
 		 283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  39.1 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  39.1 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  39.1 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  39.1 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  39.1 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  37.59 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  36.78 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  38.17 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  38.82 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  30.77 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  39.48 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  41.74 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.69 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  34.9 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  35.51 
 
 		 285 aa  118  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  32.13 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  34.88 
 
 		 301 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  36.55 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  32.22 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  33.08 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  35.12 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  34.9 
 
 		 323 aa  105  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  31.56 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  34.09 
 
 		 269 aa  102  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  36.24 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  35.25 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  35.27 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  32.46 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  35.53 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  34.98 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  33.19 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  38.2 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.21 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  30.98 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  33.09 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  32.26 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.35 
 
 		 301 aa  98.6  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  33.73 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  31.49 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  30.6 
 
 		 271 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  33.2 
 
 		 425 aa  95.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  33.33 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  36.27 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  29.85 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  29.76 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  30.97 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  30.97 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  30.97 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.67 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  30.97 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  30.97 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  30.69 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  30.51 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  29.46 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  30.22 
 
 		 271 aa  88.6  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  31.25 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  31.25 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  34.3 
 
 		 382 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  29.68 
 
 		 483 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  32.16 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  31.25 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  32.16 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  31.25 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  32.33 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  32.33 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  31.6 
 
 		 483 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  34.16 
 
 		 310 aa  85.9  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  31.23 
 
 		 483 aa  85.5  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  29.52 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  29.52 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  30.31 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  31.3 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  29.04 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>