221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1504 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  79.28 
 
 		 284 aa  413  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  54.62 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  54.62 
 
 		 290 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  50.94 
 
 		 295 aa  265  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  46.26 
 
 		 274 aa  198  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  45.2 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  44.92 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  46.12 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  42.54 
 
 		 286 aa  181  7e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  43.42 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  44.49 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  42.34 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  40.68 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  41.2 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  38.31 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  38.43 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  38.94 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  39.91 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  40 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  38.3 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  32.82 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  38.77 
 
 		 263 aa  139  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.77 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  36.36 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  33.85 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  39.13 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  36.6 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  38.72 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  36 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  36.11 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  35.6 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  36.17 
 
 		 271 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  35.2 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  35.2 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  35.2 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  35.2 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  36.1 
 
 		 425 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  37.89 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  36.21 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  36.53 
 
 		 316 aa  128  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  36.82 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  36.82 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  40.59 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  36.82 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  36.21 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  32.89 
 
 		 284 aa  121  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  33.62 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  36.56 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  32.6 
 
 		 280 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  35.17 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  34.5 
 
 		 483 aa  118  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  33.61 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  31.33 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  34.5 
 
 		 483 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  33.47 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  33.19 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  31.47 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  33.18 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  32.37 
 
 		 270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  34.26 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  41.92 
 
 		 382 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  31.78 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  32.76 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  33.33 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  33.04 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  30.4 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  29.84 
 
 		 508 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  33.62 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  33.62 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  36.08 
 
 		 315 aa  112  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  32.6 
 
 		 289 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  31.54 
 
 		 269 aa  111  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  34.4 
 
 		 494 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  32.91 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  32.91 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  32.91 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  32.91 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  32.91 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  31.95 
 
 		 270 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  33.46 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  35.09 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  32.91 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  32.89 
 
 		 558 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  32.48 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  31.93 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  32.16 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  32.16 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  29.58 
 
 		 281 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  30.67 
 
 		 296 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  28.99 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  32.64 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  35.29 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  33.92 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  31.92 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  38.29 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  29.58 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  28.76 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>