249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1054 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  100 
 
 		 267 aa  532  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  48.31 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  47.57 
 
 		 271 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  47.57 
 
 		 271 aa  248  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  47.19 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  47.19 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  47.57 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  48.09 
 
 		 269 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  46.82 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  46.82 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  46.82 
 
 		 271 aa  245  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  46.82 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  45.42 
 
 		 271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  43.75 
 
 		 273 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  43.75 
 
 		 273 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  43.36 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  43.36 
 
 		 273 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  43.36 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  43.36 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  43.36 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  42.97 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  42.97 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  41.25 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  39.39 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  34.83 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  36.02 
 
 		 289 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  36.3 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  34.91 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  34.11 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  32.3 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  33.47 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  35.52 
 
 		 301 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  32.37 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  33.81 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  29.64 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  33.45 
 
 		 310 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  31.32 
 
 		 270 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  29.21 
 
 		 295 aa  125  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  30 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  33.61 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  31.91 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  30.74 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  33.2 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  35.32 
 
 		 382 aa  122  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  33.59 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  30.6 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  33.72 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  35.25 
 
 		 274 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  31.87 
 
 		 425 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  31.92 
 
 		 558 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  32.23 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.61 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  29.71 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  31.52 
 
 		 537 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  30.4 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  33.72 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.83 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  34.56 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  33.05 
 
 		 494 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  30.18 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  31.17 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  33.17 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  32.84 
 
 		 508 aa  107  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  31.92 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  29.07 
 
 		 323 aa  106  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  33.17 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  32.67 
 
 		 324 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  31.67 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  32.67 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  28.26 
 
 		 303 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  30.11 
 
 		 491 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  33.85 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  29.92 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  28.85 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  30.8 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  27.76 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  32.56 
 
 		 493 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  32.24 
 
 		 483 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  29.35 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  31.16 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  31.16 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  31.16 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  31.16 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  30.42 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  30.04 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  27.42 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  28.95 
 
 		 318 aa  97.1  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  29.01 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  27.27 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  29.64 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  29.64 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  29.59 
 
 		 483 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  29.64 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  30.68 
 
 		 483 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  28.73 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  28.73 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  28.73 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  28.73 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  28.73 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>