225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0784 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  100 
 
 
268 aa  529  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  32.81 
 
 
270 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  35.38 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  33.47 
 
 
267 aa  137  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  32.4 
 
 
261 aa  136  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  32.81 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  32.81 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  32.81 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  32.81 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  32.93 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  33.33 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  32.41 
 
 
271 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  32.52 
 
 
271 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  33.98 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  32.33 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  34.23 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  27.91 
 
 
285 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  32.11 
 
 
271 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  36.47 
 
 
315 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  33.2 
 
 
273 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  30.04 
 
 
289 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  33.2 
 
 
273 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  31.8 
 
 
301 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  34.38 
 
 
269 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  32.41 
 
 
259 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  32.41 
 
 
259 aa  123  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  32.41 
 
 
259 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  32.69 
 
 
279 aa  122  7e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  32.02 
 
 
259 aa  121  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  33.33 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  32.02 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  30.6 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  30.6 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  32.02 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  32.02 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  33.62 
 
 
251 aa  120  3e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  35.89 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1391  formate/nitrate transporter  32.55 
 
 
254 aa  119  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0976289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  35.1 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  38.25 
 
 
290 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  28.74 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  32.93 
 
 
269 aa  115  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  33.58 
 
 
290 aa  115  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  30.98 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  30.14 
 
 
286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  27.95 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  31.34 
 
 
292 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  32.48 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  29.28 
 
 
280 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  26.88 
 
 
318 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  33.47 
 
 
252 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  27.78 
 
 
293 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  26.26 
 
 
303 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  32.95 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  28.96 
 
 
283 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  31.2 
 
 
425 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  32 
 
 
269 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  32.69 
 
 
274 aa  105  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  29.66 
 
 
313 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  31.09 
 
 
296 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  30.89 
 
 
483 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  29.52 
 
 
483 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  32 
 
 
268 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  31.56 
 
 
269 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  31.56 
 
 
269 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  31.56 
 
 
289 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  31.56 
 
 
269 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  31.56 
 
 
268 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  31.56 
 
 
268 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  31.56 
 
 
269 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  30.67 
 
 
266 aa  102  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  25.65 
 
 
537 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  28.31 
 
 
483 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  30.22 
 
 
268 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  30.22 
 
 
268 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  30.83 
 
 
262 aa  100  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  30.22 
 
 
268 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  30.22 
 
 
268 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  37.44 
 
 
274 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  29.27 
 
 
289 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  30.22 
 
 
268 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  30.22 
 
 
268 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  30.22 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  30.22 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  30.22 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  29.54 
 
 
558 aa  99.4  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  29.76 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  29.64 
 
 
286 aa  99  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  34.26 
 
 
252 aa  99  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  29.65 
 
 
289 aa  99  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>