242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1135 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1135  formate transporter  100 
 
 		 275 aa  561  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1998  formate transporter  56.82 
 
 		 286 aa  328  7e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  56.7 
 
 		 271 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  57.2 
 
 		 285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  56.7 
 
 		 271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  56.7 
 
 		 271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  56.7 
 
 		 271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  56.7 
 
 		 271 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  57.58 
 
 		 285 aa  326  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1730  formate transporter  58.33 
 
 		 286 aa  326  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  54.01 
 
 		 286 aa  326  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  57.58 
 
 		 286 aa  325  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2242  formate/nitrite transporter  56.82 
 
 		 285 aa  324  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.57128  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  55.68 
 
 		 285 aa  320  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  56.82 
 
 		 289 aa  298  5e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  49.64 
 
 		 286 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  49.64 
 
 		 286 aa  281  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  52.51 
 
 		 558 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  49.43 
 
 		 483 aa  275  8e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  49.81 
 
 		 483 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  49.24 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  48.52 
 
 		 491 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  47.55 
 
 		 483 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  52.28 
 
 		 324 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1695  formate/nitrite transporter  52.07 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.472094  hitchhiker  0.00102766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2689  formate/nitrite transporter  52.07 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2768  formate/nitrite transporter  52.07 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.213068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2670  formate/nitrite transporter  52.07 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  45.69 
 
 		 537 aa  262  4e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  50.62 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  50.62 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  50.62 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2388  formate/nitrite transporter  47.1 
 
 		 508 aa  251  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0694768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2880  formate/nitrite transporter  48 
 
 		 494 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.910131  hitchhiker  0.000564584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1674  formate/nitrite transporter  47.74 
 
 		 493 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2639  putative formate transporter  47.47 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.501611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3714  putative formate transporter  47.08 
 
 		 282 aa  238  8e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.854705  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02384  predicted formate transporter  47.08 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1177  formate/nitrite transporter  47.08 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1184  putative formate transporter  47.08 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02346  hypothetical protein  47.08 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.378468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2626  putative formate transporter  47.08 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2774  putative formate transporter  47.08 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0138397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0933  formate/nitrite transporter  43.23 
 
 		 296 aa  222  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.91346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2864  formate/nitrite transporter  48.57 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.666076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  38.66 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  40.37 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1500  formate transporter  44 
 
 		 547 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  38.71 
 
 		 313 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  39.21 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  38.63 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  34.67 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  36.8 
 
 		 318 aa  169  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  38.15 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  35.06 
 
 		 310 aa  158  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  37.02 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  34.34 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  37.15 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  35.44 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  35.11 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  35.21 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  35.16 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  36.9 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  39.46 
 
 		 315 aa  138  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  34.25 
 
 		 280 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  35.29 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  34.94 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  30.91 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  34.16 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  33.22 
 
 		 274 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  33.57 
 
 		 274 aa  125  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  31.25 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  31.75 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  31.75 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  31.75 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  31.75 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0716  formate/nitrite transporter  32.88 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0141555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  31.39 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  31.46 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1640  formate/nitrite transporter  31.58 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  34.56 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  31.84 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  35.85 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  31.84 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  33.2 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  35.89 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  32.21 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  35.32 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>