234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1503 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  558  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  79.28 
 
 		 251 aa  413  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  57.09 
 
 		 290 aa  315  8e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  57.14 
 
 		 295 aa  309  4e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  57.44 
 
 		 290 aa  308  5e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  48.19 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  48.91 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  46.81 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  47.33 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  47.1 
 
 		 274 aa  218  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  39.3 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  41.95 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  41.85 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  40.21 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  38.23 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  40.36 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  38.25 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  37.45 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  37.68 
 
 		 278 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  38.13 
 
 		 271 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  36.71 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  34.52 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  36.33 
 
 		 280 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3826  putative formate transporter  35.69 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000257156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  36.4 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  35.34 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  35.34 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  35.34 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  35.34 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  39.05 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  35.34 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  34.98 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3755  formate transporter, putative  35.34 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130548  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  33.9 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  34.98 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  35.97 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2707  formate/nitrite transporter  35.62 
 
 		 313 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.221664 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  40 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  32.26 
 
 		 280 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 425 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 261 aa  143  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  33.7 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  36.13 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  36 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  34.42 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  32.03 
 
 		 279 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  35.16 
 
 		 279 aa  132  6e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  31.36 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1054  formate/nitrate transporter  29.64 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000464668  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  36.79 
 
 		 382 aa  129  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  32.86 
 
 		 303 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3676  putative formate transporter  34.17 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1641  putative formate transporter  34.17 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0784  formate/nitrite transporter  34.23 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  36.48 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  32.36 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  39.22 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3362  formate transporter  33.45 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.495857  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3576  putative formate transporter  33.45 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3276  formate/nitrite transporter  33.45 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.55771  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3625  formate transporter  33.45 
 
 		 259 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3583  formate transporter, putative  33.09 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  32.6 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3593  putative formate transporter  33.09 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  30.88 
 
 		 483 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3326  formate/nitrite transporter  33.09 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.669254  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  32 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  32.06 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05923  methionine gamma-lyase  31.58 
 
 		 483 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  28.88 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  34.19 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  33.09 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  30.32 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000193  formate efflux transporter  30.99 
 
 		 483 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000746052  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  32.37 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  30.85 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  32.14 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  31.75 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  32.94 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  32.75 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  33.94 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  31.05 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  32.13 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  32.75 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  31.5 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  29.96 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  32.1 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  32.94 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  31.28 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  32.13 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  33.82 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  31.14 
 
 		 276 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.32 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  34.26 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  31.69 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  31.69 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  31.69 
 
 		 268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  31.69 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  31.69 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  31.69 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>