227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0836 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0836  formate/nitrite transporter  100 
 
 		 274 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1736  formate/nitrite transporter  48.21 
 
 		 284 aa  251  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3185  formate/nitrite transporter  47.19 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0135134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00730  formate/nitrite transporter family protein  48.45 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.802131  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1844  formate/nitrite transporter  43.93 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.274179 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0292  formate/nitrite transporter  42.12 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0248284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1373  formate/nitrite transporter  41.03 
 
 		 274 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2879  formate/nitrite transporter  41.13 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.583143  normal  0.245539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1943  putativel formate transporter  41.3 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.466004  normal  0.753963 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0546  formate/nitrite transporter  41.76 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0683482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0819  formate/nitrite transporter  42.32 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225898  normal  0.0203602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  42.01 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7925  formate/nitrite transporter  42.16 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295053  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3240  formate/nitrite transporter  41.2 
 
 		 274 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.532711  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2826  formate/nitrate transporter  41.2 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.189736  hitchhiker  0.00104508 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0182  formate/nitrite transporter  39.86 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3614  formate/nitrite transporter  41.09 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.568549  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2756  formate/nitrite transporter  40.6 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2846  formate/nitrite transporter  41.64 
 
 		 270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0331  formate/nitrite transporter  40.52 
 
 		 270 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6602  formate/nitrite transporter  41.54 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.609291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5755  formate/nitrite transporter  41.54 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.582427  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6120  formate/nitrite transporter  41.54 
 
 		 280 aa  195  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.119231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02558  Formate/nitrite transporter  39.93 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1131  formate/nitrite transporter  40.07 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3480  formate/nitrite transporter  39.78 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1243  formate/nitrite transporter  40.07 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0716  formate/nitrite transporter  36.43 
 
 		 270 aa  191  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.653028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0611  formate/nitrite transporter  39.34 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0703  formate/nitrite transporter  35.98 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.709097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3067  formate/nitrite transporter  38.78 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.962754  normal  0.623416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1110  formate/nitrite transporter  40.37 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1996  formate/nitrite transporter  40.58 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0581  formate/nitrite transporter  39.85 
 
 		 274 aa  185  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0796  formate/nitrite transporter  42.8 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1862  formate/nitrite transporter  40.45 
 
 		 289 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4450  formate/nitrite transporter  38.25 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.201273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0716  formate/nitrite transporter  38.87 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.991345  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0730  formate/nitrite transporter  38.87 
 
 		 284 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.111441  normal  0.0144378 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000071  nitrite transporter from formate/nitrite family  39.23 
 
 		 283 aa  178  9e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0710  formate/nitrite transporter  38.52 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2747  formate/nitrite transporter  37.08 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.147649  normal  0.259704 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1299  formate and nitrite transporters  39.78 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21721  formate and nitrite transporters  39.78 
 
 		 303 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  decreased coverage  0.00925864  normal  0.239969 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2285  formate and nitrite transporters  38.75 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29881  formate and nitrite transporters  40.15 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3094  formate/nitrite transporter  37.35 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.853793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0109  formate/nitrite transporter  39.77 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3006  formate/nitrite transporter  41.38 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2657  formate and nitrite transporters  39.18 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00842969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1071  formate/nitrite transporter  41.2 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3728  formate/nitrite transporter  34.31 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.881486  hitchhiker  0.000165735 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1503  hypothetical protein  38.04 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.48908  normal  0.406493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  39.85 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  37.31 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2136  formate/nitrite transporter  37.06 
 
 		 295 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1811  formate/nitrite transporter  35.42 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  36.82 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  37.92 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  36.1 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  34.48 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  33.95 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1605  formate/nitrite transporter  34.08 
 
 		 289 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0135158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  35.89 
 
 		 270 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  39.09 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  34.03 
 
 		 285 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  36.3 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  31.53 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  36.09 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  30.26 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  29.59 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  31.37 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0884  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 425 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1691  formate/nitrite transporter  33.2 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.516822 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08647  formate/nitrate family transporter (Eurofung)  31.01 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0554  formate/nitrite transporter  30.08 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0311  formate/nitrite transporter  29.15 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2588  formate transporter  30.37 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1947  formate transporter  30.37 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00022093  normal  0.102506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2676  formate transporter  30.37 
 
 		 285 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  31.18 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  29.85 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  32.12 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4565  formate/nitrite transporter  37.56 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0075  formate/nitrite transporter  28.92 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00341405  normal  0.480537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25150  formate/nitrite transporter family protein  32.29 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.796989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  29.85 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3485  formate transporter  30.68 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000339994  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  29.1 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3573  formate transporter  30.45 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000029484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3739  putative formate transporter  30.45 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000466346 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3857  formate transporter  30.45 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000122376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>